Войти
Биологический темная материя - неофициальный термин для обозначения неклассифицированного или плохо изученного генетического материала. Этот генетический материал может относиться к генетическому материалу, произведенному неклассифицированными микроорганизмами. В более широком смысле, биологическая темная материя может также относиться к неизолированным микроорганизмам, о существовании которых можно судить только по генетическому материалу, который они производят. Часть генетического материала может не подпадать под три существующие области жизни: бактерии, археи и эукариоты ; таким образом, было высказано предположение, что возможная четвертая область жизни еще предстоит открыть, хотя другие объяснения также возможны. В качестве альтернативы генетический материал может относиться к некодирующей ДНК (так называемая «мусорная ДНК») и некодирующей РНК, продуцируемой известными организмами.
Считается, что большая часть геномной темной материи происходит из древних мобильных элементов и из других повторяющихся элементов низкой сложности. Некатегоризованный генетический материал обнаружен у людей и многих других видов. Их филогенетическая новизна может указывать на клеточные организмы или вирусы, из которых они произошли.
До 99 % всех живых микроорганизмов невозможно культивировать, поэтому существует мало функциональных сведений о метаболическом потенциале этих организмов.
Последовательности, которые, как считается, происходят от неизвестных микробов, называются «микробная темная материя», «темная виромия» или «темные грибы». Такие последовательности не редкость. Было подсчитано, что в материале от людей от 40 до 90% вирусных последовательностей происходят из Темной Материи. Кровь человека содержит более трех тысяч различных последовательностей ДНК, которые еще не могут быть идентифицированы.
Были разработаны алгоритмы, которые исследуют последовательности на сходство с последовательностями бактериальной 16S РНК, сходство K-мер с известными вирусами, особенности использования кодонов, или для вывода о существовании белков. Эти подходы предполагают, например, существование нового бактериофага семейства microviridae и нового бактериоидоподобного фага. Другие исследования предполагали существование 264 новых вирусных родов, обнаруженных в общедоступных базах данных, а исследование крови человека показало, что у 42% людей есть по крайней мере по одному ранее неизвестному вирусу, что составляет до 19 различных новых родов. Всестороннее исследование последовательностей ДНК из нескольких образцов человека позволило сделать вывод о существовании 4930 видов микробов, о 77% из которых ранее не сообщалось. Связанные со здоровьем результаты включают профаг, который может быть связан с циррозом печени, и семь новых последовательностей от детей с диабетом 1 типа, которые имеют характеристики вирусов. Хотя они могут существовать, в Темной Материи не было обнаружено организмов, которые явно вызывают болезни человека.
