Alphatorquevirus | |
---|---|
Классификация вирусов | |
(без рейтинга): | Вирус |
Область: | incertae sedis |
Царство: | incertae sedis |
Тип: | incertae sedis |
Класс: | incertae sedis |
Порядок: | incertae sedis |
Семейство: | Anelloviridae |
Род: | Alphatorquevirus |
Типовой вид | |
. |
Alphatorquevirus - это род из вирусов семейства Anelloviridae, в группе II по классификации Балтимора. Он включает множество типов вируса, ранее известного как TTV, вирус, передаваемый при переливании крови, или вирус тено-тено, SENV, SANBAN и другие. Род насчитывает 29 видов, включая типовой. 29 видов имеют одно и то же название, пронумерованные 1-29, и по этой причине «тено-вирусы крутящего момента» (TTV) взаимозаменяемы с Alphatorquevirus.
TTV, передаваемый при переливании крови, или вирус тено-тено впервые был обнаружен у японского пациента в 1997 году ученым-исследователем Т. Нисидзава. Вирус чрезвычайно распространен даже среди здоровых людей - до 100% в некоторых странах и примерно у 10% доноров крови в Великобритании и США. Хотя сам по себе он не вызывает симптомов гепатита, он часто обнаруживается у пациентов с заболеванием печени. По большей части, TTV-инфекция считается бессимптомной.
Первоначально обнаруженная у японских пациентов с гепатитом неизвестной причины, TTV была обнаружена в различных популяциях без доказанной патологии, включая доноров крови. Этот новый вирус был впервые обнаружен в 1997 году посредством анализа репрезентативных различий (RDA) в плазме японского пациента (инициалы T.T.) с. Последовательность (N22) из 500 нуклеотидов (нуклеотидов) сначала была охарактеризована и в дальнейшем увеличена до примерно 3700 нуклеотидов (клон TA278). В то время анализ последовательности показал, что TTV был связан с семейством Parvoviridae. В конце 1998 года два независимых исследования продемонстрировали наличие дополнительной GC-богатой области размером около 120 нуклеотидов, что привело к открытию кольцевой природы генома TTV (~ 3800 нуклеотидов). Это открытие установило связь TTV с семейством Circoviridae.
Первоначально вирус был назван TTV в честь пациента с инициалами T.T. Позже было принято название вируса крутящего момента (ожерелья) teno (от латинского tenuis - «тонкий»), так как он сохранил первоначальную аббревиатуру.
Большое количество эпидемиологических исследований позволило однозначно установить указать на глобальное распространение вируса (Африка, Северная и Южная Америка, Азия, Европа, Океания ) среди сельского и городского населения. Несмотря на то, что связь между инфекцией TTV и данной патологией не была показана, была предложена гипотеза о связи между вирусной нагрузкой и иммунным статусом хозяина. Более того, хотя изначально предполагалось, что он передается только при переливании крови, глобальное распространение вируса в популяциях и его обнаружение в различных биологических образцах (плазма, слюна, фекалии и т. Д.) Предполагают комбинированные способы распространения и, в частности, распространяется каплями слюны. Предлагалась также передача половым путем.
Родственные вирусы были обнаружены у шимпанзе, обезьян, африканских обезьян, тупай, цыплят, свиней, коров, овец и собак.
Вертикальная передача была обнаружена в свиньи.
TTV Геном представляет собой негативный, кольцевой одноцепочечный фрагмент ДНК длиной приблизительно 3,8 т.п.н.; это вирус без оболочки с диаметром вириона около 40 нм. Несмотря на некоторое сходство с членами группы Circoviridae, он не обладает гомологией последовательностей с какими-либо известными вирусами. Он классифицирован как семейство Anelloviridae.
. Его геном содержит 2 большие открытые рамки считывания, кодирующие 770 и 202 аминокислоты, а также несколько более мелких ORF. Геномная область -154 / -76 содержит критический промотор.
Изоляты были разделены на пять основных кладов, пронумерованных от 1 до 5. В геногруппу 3 TTV также входят 8 штаммов вирусов, известных как SENV-A - H.
Эти В настоящее время считается, что вирусы не вызывают заболевания у людей. Заражение этими вирусами, как правило, приводит к пожизненной виремии, и их возможная связь с заболеванием все еще исследуется. Более высокая, чем обычно, вирусная нагрузка была связана с тяжелыми идиопатическими воспалительными миопатиями, раком и волчанкой.
Исследование образцов фекалий 135 бразильцев с гастроэнтеритом показало наличие вируса у 121 (91%). Наличие нескольких генотипов было обычным явлением.
Сообщалось о присутствии этого вируса при остром повреждении легких и обострениях идиопатического фиброза легких.
Сообщалось о повышении вирусной нагрузки в случаях врожденной недостаточности связывающего маннозу лектина.
Сообщалось о возможном случае апластической анемии с гепатитом.
Сообщалось об одном случае посттрансплантационного гепатита.
Была предложена связь с раком головы / шеи.
Мало что известно о репликации TTV, однако, основываясь на исследованиях цирковирусов на животных, представляется необходимым двухцепочечная структура репликации. Некоторые исследования описывают присутствие двухцепочечной ДНК TTV в различных тканях и органах, что указывает на активную репликацию в этих локализациях. Эти результаты также минимизируют гипотетическое значение TTV при заболеваниях печени. В настоящее время нет других данных для TLMV (TTV-подобный мини-вирус - штамм, поражающий людей).