Диатомовые водоросли принадлежат к большой группе, называемой гетероконтами, в которую входят как автотрофы, такие как золотые водоросли и водоросли ; и гетеротрофы, такие как водяные формы. Классификация гетероконтов до сих пор не определена: их можно отнести к разделу, типу, царству или чему-то промежуточному. Следовательно, диатомовые водоросли ранжируются от класса, обычно называемого Diatomophyceae или Bacillariophyceae, до подразделения (= тип), обычно называемого Bacillariophyta, с соответствующими изменениями в ряды своих подгрупп.
Приблизительно 20 000 существующих диатомовых видов <Предполагается, что существует 90>, из которых на сегодняшний день названо около 12000, согласно Guiry, 2012 (другие источники дают более широкий диапазон оценок). Описано около 1000-1300 родов диатомовых, как существующих, так и ископаемых, из которых около 250-300 существуют только в виде окаменелостей.
Для многих лет диатомовые водоросли, рассматриваемые либо как класс (Bacillariophyceae), либо как филюм (Bacillariophyta), были разделены всего на 2 отряда, соответствующих центрическим и пеннатным диатомовым (Centrales и Pennales ). Эта классификация была тщательно переработана Раундом, Кроуфордом и Манном в 1990 году, которые рассматривали диатомовые водоросли в более высоком ранге (подразделение, соответствующее филюму в зоологической классификации) и преобразовали основные классификационные единицы в классы, сохранив центрические диатомеи как единый класс Coscinodiscophyceae, но разделение прежних перистых диатомовых водорослей на 2 отдельных класса, Fragilariophyceae и Bacillariophyceae (последнее старое название сохранено, но с исправленным определением), между которыми насчитывается 45 отрядов, большинство из которых новый.
Сегодня (написано в середине 2020 года) признано, что система Round et al. нуждается в пересмотре с появлением новых молекулярных исследований, однако лучшая система для его замены неясна, и современные системы широко используются, такие как AlgaeBase, Всемирный регистр морских видов и его база данных, а также система «всего живого», представленная в Ruggiero et al., 2015, все сохраняют Round et al. лечение в качестве их основы, хотя диатомовые водоросли в целом рассматриваются как класс, а не подраздел / тип, а классы Round et al. сведены к подклассам для лучшего согласования с трактовкой филогенетически смежных групп и содержащихся в них таксонов. (Ссылки см. В отдельных разделах ниже).
Одно предложение, сделанное Линдой Медлин и соавторами начиная с 2004 г., состоит в том, чтобы некоторые из центрических отрядов диатомовых водорослей, которые считаются более тесно связанными с пеннатами, были выделены в новый класс, Mediophyceae, который сам более тесно связан с пеннатными диатомовыми водорослями, чем с остальными центриками. Эта гипотеза, позже обозначенная как Coscinodiscophyceae-Mediophyceae-Bacillariophyceae или Coscinodiscophyceae + (Mediophyceae + Bacillariophyceae) (CMB), была принята Д.Г. Mann, среди прочих, который использует его в качестве основы для классификации диатомовых водорослей, представленной в Adl. et al. (2005, 2012, 2019), а также в главе Bacillariophyta Справочника протистов 2017 года под редакцией Archibald et al., с некоторыми изменениями, отражающими очевидную немонофильность Medlin et al. оригинал "Coscinodiscophyceae". Между тем, группа, возглавляемая EC Theriot, поддерживает другую гипотезу филогении, которая получила название гипотезы структурной градации (SGH), и не признает Mediophyceae как монофилетическую группу, в то время как другой анализ, проведенный Parks et al., 2018, обнаружил, что радиально-центрические диатомеи (Coscinodiscophyceae Медлина и др.) не являются монофилетическими, но поддерживают монофилию Mediophyceae минус Attheya, который является аномальным родом. Обсуждение относительных достоинств этих конфликтующих схем продолжается различными вовлеченными сторонами.
На основании того факта, что перистые диатомовые водоросли имеют или не имеют продольных бороздок. в створке, называемой швом, по классификации Раунда, Кроуфорда и Манна 1990 г. диатомовые водоросли (как Bacillarophyta) делятся на три класса, центрические (22 порядка); пеннат без шва (12 порядков); и пеннат со швом (11 порядков), а именно:
Coscinodiscophyceae. Isthmia nervosaIsthmia nervosa Coscinodiscophyceae. Odontella aurita Thalassiosirales. Stephanodiscus hantzschsch. Fragilaria под микроскопомМедлин и Качмарска в 2004 году предложили альтернативную классификацию диатомовых водорослей на основе молекулярной филогении., следующим образом. Медлин и его сотрудники создали новый класс, Mediophyceae (который можно было бы переоценить как подкласс, если диатомеи в целом были бы причислены к классу, а не к типу) для «полярноцентрических» диатомовых водорослей, которые они считают более близкими к связаны скорее с пеннатными, чем с другими центрическими диатомовыми водорослями, концепция, которой следовали и / или в дальнейшем адаптировали некоторые (например, Adl et al., 2019, см. ниже), но не все последующие исследователи в настоящее время.
В трактовке «все живое» (вплоть до существующих таксонов), проведенной Ruggiero et al., 2015, диатомовые водоросли рассматриваются следующим образом. Эта обработка в значительной степени отражает то, что использовалось Algaebase по состоянию на 2015 год, а также отражено в текущей (середина 2020 года) обработке, используемой в DiatomBase, Всемирном регистре морских видов (WoRMS), частью которого является DiatomBase, и Каталог жизни. Этот подход идентичен подходу Round et al., 1990, за исключением того, что все диатомеи рассматриваются как один класс, классы Round et al. Сокращаются до подклассов, а исходные подклассы последнего опускаются.
Следуя более ранним версиям в трактовках Adl et al. 2005 и 2012 гг., Д. Mann, в Adl et al. 2019, представил свою последнюю классификацию диатомовых водорослей следующим образом, отметив при этом: «Этот пересмотр отражает многочисленные достижения в филогении диатомовых водорослей за последнее десятилетие. Из-за плохого отбора образцов таксонов за пределами Mediophyceae и пеннатных диатомовых, а также известных и ожидаемое разнообразие всех диатомовых водорослей, многие клады находятся на высоком уровне классификации (а классификация более высокого уровня довольно плоская) ». Эта классификация рассматривает диатомовые водоросли как тип (Diatomeae / Bacillariophyta), принимает класс Mediophyceae Медлина и его сотрудников, вводит новые подтипы и классы для ряда других изолированных родов и повторно ранжирует ряд ранее установленных таксонов как подклассы, но не перечисляет заказы или семьи. Предполагаемые ранги были добавлены для ясности (Адл. И др. Не используют ранги, но предполагаемые ранги в этой части классификации очевидны из выбора используемых окончаний в рамках используемой системы ботанической номенклатуры).
Другой систематический подход к классификации был предложен в 1995 г. - система Хука, Манна и Янса. Предыдущие версии классификации Адла и др., 2019 г. появились в Адл и др. 2005 г. и Адл и др. 2012 г., также в главе " Bacillariophyta »Манна, Кроуфорда и Раунда в« Справочнике протистов 2017 года »под редакцией Арчибальда и др., В котором некоторые группы, позже названные формальными таксонами, перечислены под неофициальными названиями (лептоцилиндриды, коретриды, мелозириды и т. Д.).