Войти
Простая неаккуратная семантическая база данных (S3DB) - это распределенная система управления данными, основанная на концепциях семантической сети для управления разнородными данными.
S3DB - это программное обеспечение с открытым исходным кодом, распространяемое по лицензии Creative Commons Attribution-Noncommercial-Share Alike 3.0 США. Он написан на PHP.
S3DB был впервые предложен в 2006 году, в соответствии с аргументацией предыдущего года, что набором данных omics было бы легче управлять, если бы они были сохранены как тройки RDF.
Первая версия 1.0 была сосредоточена на поддержке механизма индексирования для управления triplestore.
Вторая версия, выпущенная в октябре 2007 года, добавила перекрестные ссылки между тройками в отдельных развертываниях S3DB для поддержки ее как распределенной инфраструктуры.
Третья версия была выпущена в июле 2008 года и предоставляет свой API через специализированный язык запросов S3QL, доступный как веб-сервис REST. Обновление этого выпуска (версия 3.5) также включает конечную точку RESTful SPARQL. В этом обновлении появилась функция самообновления, которая заменяет номера версий по дате обновления.
В 2011 году был опубликован API S3DB, который был использован для управления клиническими испытаниями в Онкологическом центре MDAnderson с помощью веб-приложения с самосборным интерфейсом.
Обоснование, основная модель данных и использование в Национальном институте рака (NIH / NCI ) Награды SPORE описаны и проиллюстрированы в 2008 Рукопись PLoS ONE и рукопись 2010 BMC Bioinformatics.
В обзорном документе 2012 года говорилось: «S3QL поддерживает механизм контроля разрешений, который позволяет пользователям указывать контекстные мелочи, такие как происхождение и контроль доступа на семантическом уровне. Эффективность S3QL была проиллюстрирована на примерах использования IB, таких как геномная характеристика рака и молекулярная эпидемиология инфекционных заболеваний. Мы ожидаем, что S3QL или его варианты будут приняты ЕО в качестве стандартного механизма контроля доступа community ".
