Научное общество Алигарха было основано сэром Сайедом Ахмедом Ханом в 1864 году. В 1862 году Сайед основал Общество переводчиков, которое раньше переводило научные книги на английском и других европейских языках на урду и хинди. Позже это общество превратилось в Научное общество Алигарха. Общество стремилось продвигать либеральное, современное образование и западные научные знания в мусульманском сообществе Индии.
. Многие из написанных им в это время эссе были на такие темы, как солнечная система, растения и жизнь животных, эволюция человека и т. д. Сэр Сайед во многих отношениях пытался преодолеть разрыв между религией и наукой.
Джай Кишан Дас, близкий индус сподвижник сэра Сайеда, служил его секретарем с 1867 по 1874 год. Он также был назначен сопрезидентом Общества пожизненно.
У Алигархского научного общества была собственная библиотека и читальный зал. Книги в основном были подарены Обществу как индийскими, так и иностранными джентльменами.
Сам сэр Сайед подарил библиотеке большое количество книг. В 1866 году Общество подписалось на сорок четыре журнала и журналов. Из них 18 были на английском языке, а остальные на урду, персидском, арабском и санскрите. Он обменивался своей публикацией с аналогичными обществами, такими как Общество по распространению полезных знаний, основанное Пандитом Харсохом Райом в Лахоре, и Общество мусульманских библиотек, основанное Моулви Абдул Латиф Хан в Калькутте. Он также обменялся своим журналом с публикациями Бенгальского азиатского общества, Калькутта.
Бюллетень института Алигарха был журналом общества.