Войти
 | |
|---|---|
| Контент | |
| Описание | a wiki человеческих однонуклеотидных полиморфизмов и генотипы |
| Типы данных. охватывают | однонуклеотидные полиморфизмы, генотипы, гены, вариации |
| Организмы | Homo sapiens |
| Контакты | |
| Первичное цитирование | PMID 22140107 |
| Доступ | |
| Веб-сайт | www.snpedia.com |
| URL-адрес загрузки | www.snpedia.com /index.php/Bulk |
| Веб-сервис URL | боты.snpedia.com / api.php |
| Разное | |
| Лицензия | Creative Commons Attribution-Noncommercial-Share Alike 3.0 Лицензия США |
| Политика курирования | wiki |
SNPedia (произносится как «snipedia») - это Веб-сайт на основе wiki биоинформатики, который служит базой данных однонуклеотидных полиморфизмов (SNP). Каждая статья о SNP содержит краткое описание, ссылки на научные статьи и веб-сайты личной геномики, а также информацию о микрочипе этого SNP. Таким образом, SNPedia может поддерживать интерпретацию результатов личного генотипирования, например, от 23andMe и аналогичных компаний.
SNPedia - это семантическая вики, поддерживаемая MediaWiki и расширение Semantic MediaWiki.
SNPedia была создана и управляется генетиком Грегом Ленноном и программистом Майком Кариазо, которые на момент основания сайта оба находились в Бетесде, штат Мэриленд.
По состоянию на 27 июня 2019 года, в базе данных сайта содержится 537 медицинских состояний и 109 729 SNP. Количество SNP в SNPedia удваивается примерно каждые 14 месяцев с августа 2007 года.
7 сентября 2019 года MyHeritage объявили о приобретении и SNPedia, и Promethease. Все файлы сырых генетических данных неевропейского происхождения, ранее загруженные в Promethease и не удаленные пользователями до 1 ноября 2019 г., должны быть скопированы в MyHeritage, и пользователи получат бесплатную учетную запись MyHeritage с платным уровнем услуг, включая сопоставление родственников и этнические группы.
Соответствующая компьютерная программа под названием Promethease, также разработанная от команды SNPedia, позволяет пользователям сравнивать результаты личной генетики с базой данных SNPedia, создавая отчет с информацией об атрибутах человека, таких как предрасположенность к заболеваниям, на основе наличия определенных SNP в их геноме.
В мае 2008 года Кариазо, используя Promethease, выиграл онлайн-конкурс, спонсируемый 23andMe, чтобы определить как можно больше информации об анонимной женщине на основе только ее генома. Кариазо победил во всех трех категориях: «точность, креативность и сообразительность». В 2009 году анонимная женщина («Лилли Мендель») оказалась соучредителем 23andMe Линдой Эйви, что позволило напрямую сравнить ее настоящие черты с теми, которые были предсказаны Promethease годом ранее.
В июньской 2008 г. статье о личной геномике врач из Медицинской школы Университета Южного Иллинойса сказал:
Доступность онлайн-инструментов, таких как SNPedia, означает, что мы теперь в положении, когда пациенты часто знают о своих последствиях риска больше, чем их врач [...]
В январе 2011 года технологический журналист Рональд Бейли опубликовал в Интернете полный результат своего отчета Promethease. В статье о своем решении в журнале Reason он заявил:
Мы быстро приближаемся к эре, в которой генетическая информация больше не является эксклюзивной или медицинской. Вместо этого, по мере того, как стоимость скрининга резко падает, а наши знания о генетике расширяются, практически каждый скоро сможет иметь свой генотип под рукой. Знание и совместное использование этой информации улучшит, а не поставит под угрозу наше самоощущение, изменит способ потребления лекарств и наши планы на будущее, а также повлияет на то, как мы относимся друг к другу.
Члены медицинского сообщества критиковали Promethease за технические сложность и плохо определенная шкала «масштабов», которая вызывает неправильные представления, замешательство и панику среди пользователей.
