Войти
 | |
|---|---|
| Контент | |
| Описание | посттрансляционная модификация база данных. |
| Контакт | |
| Исследовательский центр | Институт биохимии Макса Планка |
| Лаборатория | Отдел протеомики и передачи сигналов |
| Авторы | Флориан Гнад |
| Основное цитирование | Гнад и др. (2011) |
| Дата выпуска | 2009 |
| Доступ | |
| Веб-сайт | http://www.phosida.com |
Сфорилирование PHO SIte DA tabase PHOSIDA объединяет тысячи высоко достоверных in vivo фосфозитов, идентифицированных у различных видов на основе масс-спектрометрия технология. Для каждого фосфозита PHOSIDA перечисляет соответствующие мотивы киназы, предсказанные вторичные структуры, паттерны консервации и их динамическую регуляцию при воздействии стимула или других обработок, таких как, например, ингибирование киназы. Он включает различные организмы, начиная от эукариот, таких как человек и дрожжи, до бактерий, таких как Escherichia coli и Lactococcus lactis. Имеется даже организм архей, а именно Halobacterium salinarium. Интеграция фосфопротеомов, идентифицированных в организмах, которые репрезентативно покрывают филогенетическое дерево, позволяет исследовать события фосфорилирования с глобальной точки зрения, включая сохранение и эволюционное сохранение во времени.
Кроме того, PHOSIDA также предсказывает фосфозиты на основе поддержка векторных машин.
