Целующаяся стеблевая петля

редактировать
Пример стержневой петли РНК. Если теперь вторая стеблевая петля РНК имеет комплементарную последовательность оснований, две петли могут образовывать пару оснований, что приводит к петле поцелуев. Этот анимированный GIF показывает две петли РНК (оранжевую и зеленую), связывающиеся друг с другом в структуре, называемой целовать петлю. Две петли РНК взаимодействуют посредством стэкинг-взаимодействий и водородных связей (взаимодействующие основания показаны в представлении, заполняющем пространство).

A целующаяся петля-стебель или взаимодействие целующейся петли стебля образуется в РНК, когда два основания между двумя шпильки пара. Эти внутри- и межмолекулярные целующиеся взаимодействия важны для формирования третичной или четвертичной структуры многих РНК.

Целующиеся взаимодействия РНК, также называемые петлевые псевдоузлы, возникают, когда непарные нуклеотиды в одной петле шпильки, пара оснований с неспаренными нуклеотидами в другой петле шпильки. Когда петли шпильки расположены на отдельных молекулах РНК, их межмолекулярное взаимодействие называется комплексом поцелуев. Эти взаимодействия обычно образуются между стержнями-петлями. Однако наблюдались стабильные комплексы, содержащие только две межмолекулярные пары оснований Уотсона-Крика.

Содержание
  • 1 Биологическое значение
  • 2 Значение взаимодействия стебель-петля у ретровирусов
  • 3 См. Также
  • 4 Ссылки
  • 5 Дополнительная литература
  • 6 Внешние ссылки
Биологическое значение

Молекулы рибонуклеиновой кислоты (РНК) выполняют свою функцию в живых клетках, принимая специфические и очень сложные трехмерные структуры. Считается, что рекомбинация может быть инициирована петлями поцелуев. Рекомбинация имеет решающее значение для успешной эволюции, особенно в адаптации и выживании вирусов.

Значение взаимодействия «стебель-петля» у ретровирусов

Ретровирусы - очень похожие вирусы. в структуре, которая позволяет им молча реплицироваться внутри хоста, сохраняя его в живых до тех пор, пока репликация не будет завершена и хост больше не понадобится. Геномная РНК ретровирусов нековалентно связана с димерной структурой связи (DLS), некодирующей областью в 5 'UTR. Для взаимодействия петли поцелуя существует тройное взаимодействие, которое включает 5'-фланкирующий пурин и 2 централизованных основания в комплементарной цепи. Это взаимодействие транскрипции транскрипции в большой бороздке димера петли поцелуя.

Вирус иммунодефицита человека (ВИЧ ) представляет собой ретровирус, который может передаваться через взаимодействия жидкостей организма. Существует два типа вирусов ВИЧ: вирус иммунодефицита человека типа 1 (ВИЧ-1 ) и вирус иммунодефицита человека типа 2 (ВИЧ-2 ). Из двух типов штамма вируса иммунодефицита человека ВИЧ-1 является наиболее распространенным штаммом. РНК вируса ВИЧ-1 использует взаимодействие петли поцелуев стебля как средство распознавания, основной этап взаимодействия сайта инициации димеризации (DIS) с образованием дуплекса. Для изучения взаимодействия «целующаяся стебель-петля» было замечено, что комплекс сайта инициации димеризации (DIS) был важен для репликации вируса ВИЧ типа 1 в эукариотической клетке, и любые изменения в структуре петли стебля уменьшали взаимодействие димеризации.. Экспериментально было замечено, что in vivo мутация сайта инициации димеризации (DIS) препятствовала димеризации комплекса DIS.

См. Также
Ссылки
Дополнительная литература
Внешние ссылки
  • «Мотив петли поцелуев». Биомолекулярные изображения и фильмы для обучения. Калифорнийский университет в Санта-Барбаре.
Последняя правка сделана 2021-05-25 10:42:46
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте