Генрих Шмидт (18 декабря 1874 г. - 2 мая 1935 г.) был немецким архивариусом, естествоиспытателем, философом, профессором и учеником Эрнста Геккеля.
Шмидт родился в Хойбахе в Немецком государстве из Тюрингии. С 1890 по 1894 год он учился в педагогической школе в Хильдбургхаузене, а затем работал учителем начальной школы. В 1897 г. перешел на научную стажировку в Йену. Он учился там при финансовой поддержке Эрнста Геккеля и в 1900 году стал его личным секретарем. Поскольку Шмидту не хватало формального образования в колледже, Геккель направил его в Цюрихский университет учиться у своего бывшего ученика Арнольда Ланга. Там Шмидт получил докторскую степень в 1904 году. К 1912 году он был архивариусом в Филетическом институте, а в 1916 году он стал главой архива Геккеля. Шмидт был удостоен звания профессора в 1919 году.
После смерти Геккеля в 1920 году Шмидт стал его душеприказчиком и директором Дома Эрнста Геккеля в Йенском университете Фридриха Шиллера. Шмидт, как и Геккель до него, был также членом Deutsche Monistenbund, общества монистов. В 1920 году он стал ее председателем и оставался им до своей смерти в 1935 году. Шмидт был стойким представителем «гекелизма» и его теорий эволюционного развития. Он также был редактором журнала Monistische Monatshefte. После того, как это издание было отменено в 1933 году по политическим причинам, Шмидт основал журнал «Природа и дух».
Управление и архивирование обширного наследия Геккеля в годы после его смерти составило основную часть работы Генриха Шмидта. Однако к 1933 году идеологические и политические вопросы становились все более приоритетными. Преимущественно социал-демократическое мышление Шмидта уступило место радикальному национализму, а затем его поддержали нацисты. В этом контексте он придерживался некоторых расистских взглядов, которые, будучи крайними по сегодняшним меркам, намного превосходили мнения его коллег Людвиг Плейте и Ганс Ф.К. Гюнтер. В своих более поздних изданиях журнал Шмидта «Природа и дух» отошел от своей монистической традиции и опубликовал работы по евгенике и расовой гигиене Эрвина Баура, Ойген Фишер и Фриц Ленц. Однако их попытки переосмыслить наследие Эрнста Геккеля в национал-социалистическом значении в конечном итоге потерпели неудачу.