Жоффр y Чанг

Джеффри Чанг - профессор Калифорнийского университета в Сан-Диего. Школа Скаггса Фармация и фармацевтические науки и факультет фармакологии Медицинского факультета. Его лаборатория специализируется на структурной биологии интегральных мембранных белков, в частности, на изучении методов рентгеновской кристаллографии для решения третичных структур мембраны. белки, которые широко известны устойчивостью к кристаллизации. Лаборатория специализируется на структурах белков-переносчиков множественной лекарственной устойчивости в бактериях. В 2001 году, будучи преподавателем Исследовательского института Скриппса, Чанг был награжден Премией молодых исследователей Бекмана, разработанной для поддержки исследователей на ранних этапах их академической карьеры, за его работу над структурными биология множественной лекарственной устойчивости. Чанг объявил о переезде из Скриппса в соседний Калифорнийский университет в Сан-Диего в 2012 году.

В 2007 году Чанг и соавторы отозвали пять ранее опубликованных статей, описывающих структуры трех белков-переносчиков нескольких лекарственных препаратов после публикации другой исследовательской группой сильно различающаяся структура, что привело к обнаружению критической ошибки в пользовательских программных инструментах группы Chang. Однако с того времени Чанг опубликовал другие статьи в области структурной биологии и был награжден грантом EUREKA «за исключительно инновационные исследовательские проекты, которые могут оказать чрезвычайно значительное влияние на многие области науки» от Национальных институтов. здравоохранения.

• 1 Отказанные статьи
• 2 Недавние работы
• 3 Ссылки
• 4 Внешние ссылки

Чанг и соавторы опубликовали статьи о структуре переносчики множественной лекарственной устойчивости, известные как, и. Хотя исходные структуры широко рассматривались в данной области из-за неожиданного размещения их АТФ сайтов связывания в собранном димере, публикация дополнительной структуры в том же семействе белков указывает на то, что структуры Chang вряд ли представляют биологически активную конформацию молекул. Чанг и соавторы выпустили опровержения своих структурных документов по EmrE и MsbA, указав ошибку во внутренней программной утилите как источник неверной интерпретации данных, которая привела к появлению неправильно собранных димеров. Применение популярного инструмента проверки структуры белка к одной из отведенных структур приводит к получению баллов, которые указывают на серьезные ошибки в этой структуре.

Следующие статьи были отозваны в 2007 году:

• Chang, G; Рот, CB (2001). «Структура MsbA из E. coli: гомолог переносчиков кассет связывания АТФ с множественной лекарственной устойчивостью (ABC)». Наука. 293 (5536): 1793–800. doi : 10.1126 / science.293.5536.1793. PMID 11546864.
• Порнильос, О; Чен, YJ; Chen, AP; Чанг, Г. (2005). «Рентгеновская структура переносчика множества лекарств EmrE в комплексе с субстратом». Наука. 310 (5756): 1950–3. doi : 10.1126 / science.1119776. PMID 16373573.
• Reyes, CL; Чанг, Г. (2005). «Структура ABC транспортера MsbA в комплексе с АДФ.ванадатом и липополисахаридом». Наука. 308 (5724): 1028–31. doi : 10.1126 / science.1107733. PMID 15890884.
• Чанг, Г. (2003). «Структура MsbA из Vibrio cholera: гомолог переносчика ABC с множественной лекарственной устойчивостью в закрытой конформации». J Mol Biol. 330 (2): 419–30. PMID 12823979.
• Ma, C; Чанг, Г. (2004). «Структура эффлюксного переносчика множественной лекарственной устойчивости EmrE из Escherichia coli». Proc Natl Acad Sci USA. 101 (9): 2852–7. DOI : 10.1073 / pnas.0400137101. PMC 365709. PMID 14970332.

Этот эпизод упоминается как в научных, так и в популярных СМИ как тематическое исследование, мотивирующее совершенствование программной инженерии практики в вычислительной биологии.

В 2009 году Чанг опубликовал в журнале Science статью, в которой описал белок, который удерживает определенные вещества, включая многие лекарства, вне клеток. Белок, называемый P-гликопротеином или сокращенно P-gp, является одной из основных причин устойчивости раковых клеток к химиотерапевтическим препаратам. В 2010 году он возглавил исследование, опубликованное в журнале Nature, в котором подробно описывается структура транспортера семейства MATE (Мульти антимикробный экструзионный белок ) NorM, который принадлежит к единственному оставшемуся классу транспортеров множественной лекарственной устойчивости, который еще предстоит описать. учеными. Работа имеет значение для борьбы с опасными устойчивыми к антибиотикам штаммами бактерий, а также для создания выносливых штаммов сельскохозяйственных культур.

1. ^«Джеффри Чанг». Фонд Арнольда и Мейбл Бекман. Проверено 1 августа 2018 г.
2. ^Новости и обзоры Исследовательского института Скриппса. Вкратце 1 (9): 2 апреля 2001 г. Дата доступа 17 января 2001 г.
3. ^Роббинс, Гэри (9 октября 2012 г.). «Исследование Скриппса теряет пятого талантливого ученого». Сан-Диего Юнион-Трибьюн. Проверено 10 февраля 2015 г.
4. ^ Miller, G (2006). «Научные публикации. Кошмар ученого: проблема программного обеспечения приводит к пяти отзывам». Наука. 314 (5807): 1856–7. doi : 10.1126 / science.314.5807.1856. PMID 17185570.
5. ^ Aller, S.; и другие. (2009). «Структура P-гликопротеина выявляет молекулярную основу полиспецифического связывания лекарств». Наука. 323 (5922): 1718–1722. doi : 10.1126 / science.1168750. PMC 2720052. PMID 19325113.
6. ^ He et al., «Структура катионно-связанного экструзионного транспортера для множественных лекарственных и токсичных соединений», http://www.nature.com/nature/journal /vaop/ncurrent/abs/nature09408.html
7. ^Исследовательский институт Скриппса Джеффри Чанг получил награду EUREKA http://www.scripps.edu/newsandviews/e_20100920/etc.html
8. ^Хиггинс, CF; Линтон, KJ (2001). «Структурная биология. Xyz транспортеров ABC». Наука. 293 (5536): 1782–4. doi : 10.1126 / science.1065588. PMID 11546861.
9. ^Доусон, Род-Джерси; Лочер, КП (2006). «Структура бактериального мультилекарственного переносчика ABC». Природа. 443 (7108): 180–5. doi : 10.1038 / nature05155. PMID 16943773.
10. ^ Чанг, G; Рот, CB; Рейес, К.Л.; Порнильос, О; Чен, YJ; Чен, AP (2006). «Отзыв». Наука. 314 (5807): 1875. doi : 10.1126 / science.314.5807.1875b. PMID 17185584.
11. ^Wiederstein, M; Сиппл, MJ (2007). «ProSA-web: интерактивный веб-сервис для распознавания ошибок в трехмерных структурах белков». Nucleic Acids Res. 35 (проблема с веб-сервером): W407–10. doi : 10,1093 / нар / гкм290. ПМЦ 1933241. PMID 17517781.
12. ^Гаврилевски А. (2006). Опровержения нарушают структурную биографию: недавние результаты опровергают выводы из пяти широко цитируемых статей The Scientist 4 января 2007 г. Полный текст бесплатно Дата доступа 17 января 2007 г.
13. ^Perkel, Jeffrey M. (29 июня 2011 г.). «Кодируйте свой выход из проблемы». Природные методы. 8 (7): 541–543. doi : 10.1038 / nmeth.1631. PMID 21716280.
14. ^Теннер, Эдвард (7 декабря 2012 г.). «Программное обеспечение с ошибками: Ахиллесова пята науки, основанной на больших данных?». Атлантический океан. Проверено 10 февраля 2015 г.
15. ^Ученые обнаружили структуру белка, который делает раковые клетки устойчивыми к химиотерапии http://www.scripps.edu/newsandviews/e_20090330/chang.html
16. ^Исследовательский институт Скриппса http://www.scripps.edu/news/press/20100922 Архивировано 28 сентября 2010 г. на Wayback Machine

• Профиль преподавателя UCSD