Войти
 | |
|---|---|
| Содержимое | |
| Описание | информация о бактериальных и архейных штаммах |
| Типы данных. захваченные | метаданные |
| Связаться с | |
| Исследовательский центр | Институт Лейбница DSMZ - German Collection of Microorganisms and Cell Cultures GmbH |
| Первичное цитирование | PMID 26424852 |
| Выпуск дата | 2012 |
| Доступ к | |
| Веб-сайт | http://bacdive.dsmz.de/ |
| Веб-сервис URL-адрес | http://bacdive.dsmz.de / api / |
BacDive (база метаданных по бактериальному разнообразию ) - это бактериальная база метаданных, которая предоставляет связанную с штаммом информацию о бактериях и архей биоразнообразие.
BacDive - это ресурс для различных типов метаданных, таких как таксономия, морфология, физиология, окружающая среда и молекулярная биология. Большинство данных аннотируются и обрабатываются вручную. С выпуском в июле 2018 года BacDive предлагает информацию о 63 669 штаммах. База данных находится в ведении DSMZ института Лейбница - Немецкая коллекция микроорганизмов и клеточных культур и является частью de.NBI Немецкой сети биоинформатической инфраструктуры.
Версия базы данных, выпущенная в июле 2018 г., включала более 600 различных полей данных, разделенных на категории «Название и таксономическая классификация», «Морфология и физиология »,« Культура и условия роста »,« Изоляция, отбор проб и информация об окружающей среде ». «Применение и взаимодействие», «Молекулярная биология» и «Доступность штаммов». База данных содержит 712 958 записей, связанных с соответствующим штаммом и эталоном. Данные взяты из внутренних описаний коллекций культур, составленных экспертами сборников по штаммам и первичной научной литературы.
Доступ к данным можно получить либо через GUI, либо через веб-службу RESTful . Используя графический интерфейс, пользователь может выбирать между простым поиском для поиска в основных полях, таких как таксономия или идентификатор штамма, или пользователь может использовать расширенный поиск, который позволяет выполнять поиск в 130 полях данных и дает возможность выполнять сложные запросы путем объединения нескольких полей.. Данные можно загрузить в формате PDF (для отдельных штаммов) или в формате CSV для больших наборов данных (для нескольких штаммов). Через портал веб-сервиса можно получить доступ не только к контенту BacDive, но и к справочному списку таксонов Обновленная номенклатура прокариот.
Для данных, выходящих за рамки BacDive, предусмотрены ссылки на другие базы данных, доставляющие данные, связанные со штаммом:
 | Викиданные имеют свойство:
|
