Войти
| Avsunviroidae | |
|---|---|
Классификация вирусов  | |
| (без рейтинга): | Вирус |
| Область: | incertae sedis |
| Царство: | incertae sedis |
| Тип: | incertae sedis |
| Класс: | incertae sedis |
| Порядок: | incertae sedis |
| Семейство: | Авсунвироиды |
| Роды | |
Авсунвироиды - это семейство вироидов. Существует четыре вида трех родов (авсунвироид, элавироид и пеламовироид ). Они состоят из геномов РНК длиной 246-375 нуклеотидов. Они представляют собой одноцепочечные ковалентные круги и имеют внутримолекулярное спаривание оснований. У всех членов отсутствует центральная консервативная область.
Репликация происходит в хлоропластах растительных клеток. Ключевые особенности репликации включают отсутствие необходимости в вирусе-помощнике и кодировании белков. В отличие от другого семейства вироидов, Pospiviroidae, Avsunviroidae, как полагают, размножаются посредством симметричного перекатывающегося механизма. Считается, что положительная цепь РНК действует как матрица для образования отрицательных цепей с помощью фермента, который считается РНК-полимеразой плюс 3 II. Затем отрицательные цепи РНК расщепляются под действием рибозима и циркулируют. Второй механизм катящегося круга формирует положительную цепь, которая также расщепляется под действием рибозима, а затем лигируется, чтобы стать кольцевой. Сайт репликации неизвестен, но предполагается, что он находится в хлоропласте и в присутствии ионов Mg.
Согласно прогнозам структуры, они существуют либо в виде палочковидных молекул. с областями спаривания оснований, вызывающими образование петель или разветвленной конфигурацией.
Семейство имеет четыре отрезка консервативных нуклеотидов, guuuc, uc, ucag, acот 5 'до 3', плюс их пары Уотсон-Крик на другом конце петли. Это часть его рибозима «голова молота».
Семейство состоит из трех родов, всего пять видов.
Отсутствие длинной центральной консервативной области затрудняет идентификацию авсунвироидных, чем Pospiviroidae. Методом их обнаружения является использование их цикличности: компьютер может объединить множество перекрывающихся считываний, которые при линейном размещении образуют повторы.
