SciCrunch

SciCrunch - это совместно редактируемая база знаний о научных ресурсах, портал сообщества для исследователей и система управления контентом для данных и баз данных. Он предназначен для обеспечения общего источника данных для исследовательского сообщества и данных об идентификаторах исследовательских ресурсов (RRID ), которые могут использоваться в научных публикациях. В некотором отношении он предназначен для науки и научных публикаций, подобно тому, как Викиданные предназначены для проектов Фонда Викимедиа. Размещаемый в Калифорнийском университете в Сан-Диего, SciCrunch также был разработан, чтобы помочь сообществам исследователей создавать свои собственные порталы для обеспечения доступа к ресурсам, базам данных и инструментам, имеющим отношение к их областям исследований.

• 1 Идентификаторы исследовательских ресурсов
• 2 Формат цитирования RRID
• 3 Учреждения и издатели, рекомендующие использование RRID
• 4 См. Также
• 5 Внешние ссылки
• 6 Ссылки

Идентификаторы исследовательских ресурсов (RRID) должны быть идентификаторами ресурсов, которые являются глобально уникальными и постоянными. Они были введены и продвигаются Инициативой по идентификации ресурсов . Ресурсы в этом контексте - это исследовательские ресурсы, такие как реагенты, инструменты или материалы. Примером такого ресурса может быть линия клеток, используемая в эксперименте, или программный инструмент, используемый в вычислительном анализе. Портал идентификации ресурсов (https://scicrunch.org/resources ) был создан в поддержку этой инициативы и является центральной службой, где можно искать и создавать эти идентификаторы. Эти идентификаторы должны быть полностью доступны для поиска с помощью интеллектуального анализа данных, в отличие от дополнительных файлов, и могут обновляться до новых версий по мере изменения базовой методологии с течением времени.

Ниже показаны рекомендации по цитированию исследовательских ресурсов для ключевых биологических ресурсов:

• Антитело: Millipore Cat № MAB377 (Lot) RRID: AB_2298772
• Модель организма: NXR № по каталогу 1.0049, RRID: NXR_1.0049
• Линия клеток: Coriell № по каталогу GM03745, RRID: CVCL_1H60
• Инструменты: Программное обеспечение для анализа изображений CellProfiler, (версия или дата) RRID : SCR_007358

Портал идентификации ресурсов перечисляет существующие RRID и инструкции по созданию нового, если RRID, соответствующий ресурсу, еще не существует.

Ряд издательств, инициатив и исследовательских институтов поощряют использование RRID SciCrunch:

• Common Citation Format Article in Nature
• Cell Press
• eLIFE
• FORCE11
• Frontiers Media
• GigaScience
• MIRIAM Registry
• NIH
• PLOS Biology и PLOS Genetics

• LSID
• Resource Description Framework
• Тег (метаданные)

• Официальный сайт
• RRID Resolver

1. ^Джеффри, Грет; Анита, Бандровски; Дэвис, Бэнкс; Кристофер, Кондит; Амарнатх, Гупта; Стивен, Ларсон; Юелинг, Ли; Ибрагим, Озюрт; Андреа, Стэгг; Патрисия, Ветзель; Луис, Маренко; Перри, Миллер; Риксин, Ван; Гордон, пастырь; Марианн, Мартоне (2014). «SciCrunch: совместная платформа для поиска данных и ресурсов для научных сообществ». Границы нейроинформатики. 8. doi : 10.3389 / conf.fninf.2014.18.00069.
2. ^ Бандровски, Анита; Кисть, Мэтью; Грет, Джеффри С.; Хендель, Мелисса А. ; Кеннеди, Дэвид Н.; Хилл, Шон; Хоф, Патрик Р.; Martone, Maryann E.; Польс, Мааике; Тан, Серена; Вашингтон, Николь; Зудилова-Сейнстра, Елена; Василевский, Николь; дополнительные авторы являются участниками Resource Identification Initiative (https://www.force11.org/node/4463/members ) (19 ноября 2015 г.). «Инициатива идентификации ресурсов: культурный сдвиг в издательском деле». F1000Research. 2. 4 (134): 134. doi : 10.12688 / f1000research.6555.2. PMC 4648211. PMID 26594330.
3. ^«Что такое ресурс?». scicrunch.org. SciCrunch. Проверено 7 января 2018 г.
4. ^«Портал идентификации ресурсов». scicrunch.org. SciCrunch. Проверено 7 января 2018 года.
5. ^Сингх Чавла, Далмит (2015). «Исследователи выступают за общий формат». Природа. doi : 10.1038 / nature.2015.17652. S2CID 211730637.
6. ^"Cell Press: Neuron". www.cell.com.
7. ^«eLife присоединяется к Инициативе по идентификации ресурсов». 2016-07-07.
8. ^«Инициатива по идентификации ресурсов». FORCE11. 2013-08-14. Проверено 18 апреля 2016 г.
9. ^«Руководство для авторов Frontiers». Границы. Проверено 19 апреля 2016 г.
10. ^«Техническая записка | GigaScience | Oxford Academic». Acade.oup.com. Проверено 15 июля 2019 г.
11. ^"identifiers.org". Сбор данных: RRID. Проверено 18 апреля 2016 г.
12. ^«NIDA поддерживает SciCrunch и RRID, делая исследовательские ресурсы видимыми в науке». FORCE11. 2016-03-07. Проверено 18 апреля 2016 г.
13. ^«Представляем инициативу по идентификации исследовательских ресурсов в PLOS Biology PLOS Genetics». PLOS Biologue. 2015-01-29. Проверено 18 апреля 2016 г.

Узнать больше о SciCrunch и RRID: Интервью с доктором Анитой Бандровски