Salterprovirus

Salterprovirus
Классификация вирусов
(без рейтинга):	Вирус
Область:	incertae sedis
Царство:	incertae sedis
Тип:	incertae sedis
Класс:	incertae sedis
Порядок:	incertae sedis
Семейство:	Halspiviridae
Род:	Salterprovirus
Типовой вид
Salterprovirus His1.

Salterprovirus - это род вирусов, заразить чрезвычайно галофильные археи (выделенные из Haloarcula hispanica. В настоящее время в этом роду существует только один вид: типовой вид Salterprovirus His1. Первоначально считалось, что он связан с His1, но более обширная характеристика вириона His2 показала, что он принадлежит к семейству Pleolipoviridae. Название рода происходит от saltter minal pro tein virus, поскольку их линейные геномы дцДНК имеют белки, прикрепленные к 5'-концам. (т.е. концевые белки). Этот морфотип вируса обычно наблюдается в гиперсоленых водах по всему миру, а сальтерпровирусы могут представлять собой распространенный в окружающей среде галовирус.

• 1 Таксономия
• 2 Структура
• 3 Жизненный цикл
• 4 Обсуждение His1V и His2V
• 5 Ссылки
• 6 Внешние ссылки

Вирион имеет веретенообразную морфологию и похож по форме на вирусы, заражающие термофильные археи, Fuselloviridae, и His1V первоначально был описан как вероятный член этой группы. Однако позже было обнаружено, что генетического родства нет, а их стратегии репликации совершенно разные, и поэтому His1 был классифицирован в новую группу, род Salterprovirus в семействе Halspiviridae.

Вирусы у Salterprovirus - обволакивающие, имеющие лимонную или веретеновидную морфологию. Геномы линейны, их длина составляет около 14,5 килобайт. Геном имеет 35 открытых рамок считывания.

Репликация вируса происходит в цитоплазме. Проникновение в клетку-хозяина достигается за счет прикрепления вируса к клетке-хозяину. Транскрипция с использованием ДНК-шаблона - это метод транскрипции. Археи и haloarcula hispanica служат естественным хозяином. Маршруты передачи - пассивная диффузия.

Геномы His1 и His2 похожи по размеру (14,464 п.н. и 16,067 п.н. соответственно) и имеют такое же количество предсказанных открытых рамок считывания (35), но они почти не имеют сходства нуклеотидных последовательностей. Однако на уровне белковых последовательностей их ДНК-полимеразы идентичны на 42%. Это, вместе с их сходной морфологией, структурой ДНК (длина, последовательности инвертированных концевых повторов, концевые белки) и способом репликации указывает на то, что они должны принадлежать к одной и той же группе вирусов.. Изображение частиц His1 можно увидеть на веб-сайт www.haloarchaea.com здесь и прокрутите вниз. Любопытно, что гомологи генов капсидных белков His2 широко распространены в геномах галоархей. Геномные локусы, содержащие их, также имеют тенденцию иметь поблизости другие гены вируса / плазмиды, и термин ViPREs (для элементов, связанных с вирусами и плазмидами) был предложен для обозначения этих кластеров генов, что может быть аналогично ситуации в термофильных Археи, где плазмиды и вирусы тесно связаны.

Трансфекция клеток-хозяев (Haloarcula hispanica ) ДНК His2 была продемонстрирована Porter et al. (2008), которые показали, что инфекционный вирус может быть получен из вирусной ДНК, если концевые белки не были повреждены обработкой протеазой. Это согласуется с их вероятной ролью в репликации ДНК. Затем можно было показать, что ДНК His2 могла трансфицировать широкий спектр видов галоархей, даже если клетки не были восприимчивы к инфекции вирусом His2. В этих экспериментах трансфицированные клетки высевали вместе с клетками хозяина, Haloarcula hispanica, и вирус, продуцируемый трансфектантами, выявляли путем инфицирования соседних клеток восприимчивых видов хозяев. Эксперименты показали, что цитоплазмы многих галоархей способны реплицировать вирус до тех пор, пока может проникать ДНК (с концевыми белками). Именно капсид вируса определяет селекцию клеток, скорее всего, белками в коротком хвосте на одном конце веретенообразного вириона.

После того, как трансфекция была установлена, стало возможным разработать систему мутагенеза, и в той же публикации описано использование системы транспозона in vitro для случайной вставки ДНК в геном His2. Трансфекция продуктов реакции привела к выделению рекомбинантов вируса со вставками и картированию этих локализованных участков генома His2, которые были несущественными. Было обнаружено, что большинство вставок лежит в одной из двух последовательностей инвертированных концевых повторов (ITR). Некоторые из них произошли на самых концах трех открытых рамок считывания. Исследование доказало, что вы можете создать мутанты His2, что вы можете вставить в геном не менее 435 дополнительных п.н., и вы можете восстановить жизнеспособные мутанты с помощью этих вставок. Это открывает путь к анализу функций каждого из вирусных генов, того, что они делают и как взаимодействуют друг с другом и с клеткой-хозяином. В настоящее время почти все предсказанные вирусные белки не имеют известной функции. Неясно, сколько дополнительной ДНК можно вставить в геном, но, как видно из электронной микрофотографии, размер капсида не может быть ограничивающим фактором, поскольку размеры частиц His1 значительно различаются по длине (и, вероятно, для His2, хотя негативное окрашивание ЭМ этих частиц намного сложнее).

• Viralzone : Salterprovirus
• ICTV