Войти
A предполагаемый ген - это сегмент ДНК, который считается геном . Предполагаемые гены могут иметь сходство последовательностей с уже охарактеризованными генами, и, таким образом, можно сделать вывод, что они обладают сходной функцией, но точная функция предполагаемых генов остается неизвестной. Вновь идентифицированные последовательности считаются предполагаемыми кандидатами в гены, когда обнаруживается, что гомологи этих последовательностей связаны с интересующим фенотипом.
Примеры исследований с участием предполагаемых генов включают открытие 30 предполагаемых генов рецепторов, обнаруженных в вомероназальном органе крысы (VNO) и идентификация 79 предполагаемых ТАТА-боксов, обнаруженных во многих геномах растений.
Чтобы определить и охарактеризовать кластер биосинтетических генов, все предполагаемые гены в указанном кластере должны быть сначала идентифицированы и их функции должны быть охарактеризованы. Это может быть выполнено с помощью экспериментов по дополнению и выбиванию. В процессе характеристики предполагаемых генов изучаемый геном становится все более понятным, поскольку можно идентифицировать больше взаимодействий. Идентификация предполагаемых генов необходима для изучения геномной эволюции, поскольку значительная часть геномов составляет более крупные семейства связанных генов. Геномная эволюция происходит с помощью таких процессов, как дублирование отдельных генов, сегментов генома или целых геномов. Эти процессы могут привести к потере функции, изменению функции или усилению функции, а также оказывают сильное влияние на фенотип.
Мутации ДНК вне предполагаемого гена могут действовать посредством позиционного эффекта, при котором они изменяют экспрессию гена. Эти изменения оставляют единицу транскрипции и промотор гена нетронутыми, но могут включать дистальные промоторы, элементы энхансера / сайленсера или локальное окружение хроматина. Эти мутации могут быть связаны с заболеваниями или нарушениями, связанными с данным геном..
Предполагаемые гены могут быть идентифицированы путем кластеризации больших групп последовательностей по образцам и упорядочивания по взаимному сходству или могут быть выведены на основе потенциальных Блоки TATA.
Предполагаемые гены также можно идентифицировать, распознавая различия между хорошо известными кластерами генов и кластерами генов с уникальным профилированием.
Были разработаны программные средства для автоматической идентификации предполагаемых генов. Это осуществляется путем поиска семейств генов и проверки достоверности не охарактеризованных генов по сравнению с уже идентифицированными генами.
Белковые продукты могут быть идентифицированы и использованы для характеристики предполагаемого гена, который их кодирует.
