Войти
В молекулярной биологии, PathoPhenoDB - это биологическая база данных, созданная Kafkas et al. al. Эта база данных связывает патогены с их фенотипами с помощью нескольких баз данных, таких как NCBI, Human Disease Ontology Human Phenotype Ontology, Mammalian Phenotype Ontology, PubChem, SIDER и CARD. Связи патоген-заболевание были собраны в основном на CDC и на странице Список инфекционных заболеваний в Википедии. Методика присвоения таксономии была полуавтоматической. При сопоставлении с таксономией NCBI, если патоген не был точным совпадением, он затем сопоставляется с родительским классом. PathoPhenoDB использует NPMI для фильтрации пар на основе их статистики совместной встречаемости.
.
