Войти
 | |
 Снимок экрана OpenChrom Community Edition версии 1.3.0 "Dalton" | |
| Разработчик (и) | Lablicate Научное сообщество |
|---|---|
| Стабильный выпуск | 1.3.0 / 8 августа 2018 г. (2018-08-08) |
| Написано на | Java |
| Операционная система | Кросс-платформенная |
| Тип | Хемоинформатика / Биоинформатика |
| Лицензия | EPL, сторонние библиотеки под различными OSI совместимые лицензии |
| Веб-сайт | https://www.openchrom.net |
OpenChrom - это программное обеспечение с открытым исходным кодом для анализа и визуализации массовых спектрометрический и хроматографические данные. Его задача - обрабатывать собственные файлы данных из нескольких систем масс-спектрометрии (например, ГХ / МС, ЖХ / МС, Py-GC / MS, HPLC-MS), таких поставщиков, как Agilent Technologies, Varian, Шимадзу, Thermo Fisher, PerkinElmer и другие. Но также в последнее время поддерживаются форматы данных от других типов детекторов.
OpenChrom поддерживает только анализ и представление хроматографических и масс-спектрометрических данных. У него нет возможностей для сбора данных или управления оборудованием поставщика. OpenChrom построен на клиентской платформе Eclipse Rich Client Platform (RCP), поэтому он доступен для различных операционных систем, например Microsoft Windows, macOS и Linux. Он распространяется под общественной лицензией Eclipse 1.0 (EPL). Сторонние библиотеки разделены на отдельные пакеты и выпускаются под различными OSI совместимыми лицензиями.
ChemClipse версии 0.7.0 OpenChrom был разработан Филипом Венигом (SCJP, LPIC-1 ) как часть защитил докторскую диссертацию в Гамбургском университете, Германия. В центре внимания диссертации было применение методов распознавания образов для наборов данных, записанных с помощью аналитического пиролиза в сочетании с хроматографией и масс-спектрометрией (Py-GC / MS).
OpenChrom выиграл премию Thomas Krenn Open Source Award 2010, а также Премия сообщества Eclipse 2011. Разработчики также являются членами-основателями рабочей группы Eclipse Science. После успешной коммерциализации контрактной разработки и услуг по проекту OpenChrom, поставщик Lablicate подтвердил приверженность Бесплатному / Libre / ПО с открытым исходным кодом, выпустив ChemClipse в октябре 2016 года, который служит основой для всех OpenChrom
Команда Lablicate интегрирована в отдел масс-спектрометрии Гамбургского университета. Они предоставляют свои хемометрические знания студентам и исследователям.
Каждый поставщик системы хранит записанные данные анализа в собственном частном формате. Это затрудняет сравнение наборов данных от разных систем и поставщиков. Кроме того, это большой недостаток для межлабораторных испытаний. Цель OpenChrom - изначально поддерживать широкий диапазон различных форматов данных масс-спектрометрии. OpenChrom заботится о том, чтобы файлы необработанных данных нельзя было изменить в соответствии с надлежащей лабораторной практикой. Чтобы помочь ученым, OpenChrom поддерживает несколько открытых форматов для импорта и экспорта результатов анализа. Кроме того, OpenChrom предлагает собственный формат с открытым исходным кодом (*.ocb), который позволяет сохранять отредактированную хроматограмму, а также пики и результаты идентификации.
OpenChrom предлагает множество функций для анализа хроматографических данных:
Впервые программа была выпущена в 2010 году. Каждая версия названа в честь известного ученого.
| Кодовое имя | Эпоним | Дата | Версия |
|---|---|---|---|
| Томсон | Джозеф Джон Томсон | апрель 2010 г. | Старая версия, нет больше не поддерживается: 0.1.0 |
| Goldstein | Eugen Goldstein | май 2010 | Старая версия, больше не поддерживается: 0.2.0 |
| Wien | Wilhelm Wien | октябрь 2010 | Старая версия, больше не поддерживается: 0.3.0 |
| Цветт | Михаил Семенович Цветт | апрель 2011 г. | Старая версия, больше не поддерживается: 0.4.0 |
| Мартин | Арчер Джон Портер Мартин | октябрь 2011 | Старая версия, больше не поддерживается: 0.5.0 |
| Synge | Ричард Л.М. Синдж | апрель 2012 | Старая версия, больше не поддерживается: 0.6.0 |
| Нернст | Вальтер Нернст | Октябрь 2012 | Старая версия, больше не поддерживается: 0.7.0 |
| Демпстер | Артур Джеффри Демпстер | июль 2013 г. | Старая версия, больше не поддерживается: 0.8.0 |
| Mattauch | Josef Mattauch | июль 2014 | Старая версия, больше не поддерживается: 0.9. 0 |
| Астон | Фрэнсис Виллиа m Aston | июль 2015 г. | Старая версия, больше не поддерживается: 1.0.0 |
| Diels | Otto Diels | июль 2016 | Старая версия, больше не поддерживается: 1.1.0 |
| Ольха | Курт Алдер | август 2017 | Старая версия, больше не поддерживается: 1.2.0 |
| Dalton | John Dalton | август 2018 | Старая версия, больше не поддерживается: 1.3.0 |
| Лоуренс | Эрнест Лоуренс | август 2019 | Текущая стабильная версия: 1.4.0 |
