Многоволновая аномальная дисперсия

Многоволновая аномальная дифракция (иногда Многоволновая аномальная дисперсия ; сокращенно MAD ) - это метод, используемый в рентгеновской кристаллографии, который облегчает определение трехмерной структуры биологических макромолекул (например, ДНК, рецепторов лекарств) через раствор фазы. проблема.

MAD был разработан Уэйном Хендриксоном, когда он работал докторантом под руководством Джерома Карла в Лаборатории военно-морских исследований США. Математика, на которой основывались MAD (и предшественник аномальной дисперсии на одной длине волны ), была разработана Джеромом Карле, за работу которого он был удостоен Нобелевской премии по химии 1985 года (вместе с Гербертом Хауптманом ).

• 1 См. Также
• 2 ссылки
  • 2.1 Дальнейшее чтение
• 3 Внешние ссылки
  • 3.1 Компьютерные программы
  • 3.2 Учебники и примеры

• Одноволновая аномальная дисперсия (SAD)
• Множественная изоморфная замена (MIR)
• Аномальное рассеяние
• Аномальное рассеяние рентгеновских лучей
• Карта Паттерсона

дальнейшее чтение

• Хендриксон WA (1985). «Анализ структуры белка по дифракционным измерениям на множестве длин волн». Сделки ACA. 21.
• Карл Дж (1980). "Некоторые разработки в области аномальной дисперсии для структурных исследований макромолекулярных систем в биологии". Международный журнал квантовой химии: симпозиум по квантовой биологии. 7 : 357–367. DOI : 10.1002 / qua.560180734.
• Карл Дж (1989). «Линейный алгебраический анализ структур с одним преобладающим типом аномального рассеивателя». Acta Crystallographica. 45 (4): 303–307. DOI : 10.1107 / s0108767388013042. PMID   2559755.
• Палер А., Смит Дж. Л., Хендриксон В. А. (1990). «Вероятностное представление информации о фазе из многоволновой аномальной дисперсии». Acta Crystallographica. 46 (7): 537–540. DOI : 10.1107 / s0108767390002379.
• Тервиллигер TC (1994). «MAD Phasing: байесовские оценки FA». Acta Crystallographica D. 50 : 11–16. DOI : 10.1107 / s0907444993008224.
• Тервиллигер TC (1994). «Стадия MAD: обработка дисперсионных различий как информации об изоморфном замещении». Acta Crystallographica D. 50 (Pt 1): 17–23. DOI : 10.1107 / s0907444993008236. PMID   15299472.
• Fourme R, Shepard W., Kahn R, l'Hermite G, de La Sierra, Иллинойс (1995). «Метод многоволновой аномальной контрастности растворителя (MASC) в макроколекулярной кристаллографии». Журнал синхротронного излучения. 2 (Pt 1): 36–48. DOI : 10.1107 / S0909049594006680. PMID   16714785.
• de la Fortelle E, Bricogne G (1997). "Максимальное правдоподобие уточнения параметров тяжелых атомов для множественных изоморфных замещений и методов многоволновой аномальной дифракции". Методы в энзимологии. 276 : 472–494. DOI : 10.1016 / S0076-6879 (97) 76073-7. ISBN   978-0-12-182177-7. PMID   27799110. Цитировать журнал требует |journal= ( помощь )
• Хендриксон WA, Огата CM (1997). "Определение фазы из измерений аномальной дифракции на многих длинах волн". Методы в энзимологии. 276 : 494–523. DOI : 10.1016 / S0076-6879 (97) 76074-9. ISBN   978-0-12-182177-7. PMID   27799111. Цитировать журнал требует |journal= ( помощь )
• Белла Дж, Россманн MG (1998). «Общий алгоритм фазирования для множественных данных MAD и MIR». Acta Crystallographica D. 54 (2): 159–174. DOI : 10.1107 / s0907444997010469. PMID   9761882.
• Гусс Дж. М., Мерритт Е. А., Физакерли Р. П., Хедман Б., Мурата М., Ходжсон К. О., Фриман ХК (1989). «Определение фазы с помощью дифракции рентгеновских лучей с множеством длин волн: кристаллическая структура основного синего белка меди из огурцов». Наука. 241 (4867): 806–811. Bibcode : 1988Sci... 241..806G. DOI : 10.1126 / science.3406739. PMID   3406739.

• MAD phasing - подробное руководство с примерами, иллюстрациями и ссылками.
• HHMI Bio для Уэйна Хендриксона
• Домашняя страница Уэйна Хендриксона
• Хендриксон Лаборатория Резюме исследований
• Джером Карл Нобель биография
• Признание НРЛ Нобелевской премии

Компьютерные программы

• Пакет абсорбции SSRL - Бреннан С., Коуэн П.Л. (1992). «Набор программ для расчета характеристик поглощения, отражения и дифракции рентгеновских лучей для различных материалов на произвольных длинах волн». Обзор научных инструментов. 63 (1): 850. Bibcode : 1992RScI... 63..850B. DOI : 10.1063 / 1.1142625.
• CHOOCH - Эванс Г., Петтифер РФ (2001). "CHOOCH: программа для получения факторов аномального рассеяния из спектров рентгеновской флуоресценции". Журнал прикладной кристаллографии. 34 : 82–86. DOI : 10.1107 / S0021889800014655.
• Встряхните и испеките ( SnB ) - Смит Г.Д., Нагар Б., Рини Дж. М., Хауптман Г. А., Благословение Р. Х. (1998). «Использование Snb для определения субструктуры аномального рассеяния». Acta Crystallographica D. 54 (Pt 5): 799–804. DOI : 10.1107 / S0907444997018805. PMID   9757093.
• SHELX - Шелдрик GM (1998). «ШЕЛКС: приложения к макромолекулам». В С. Фортье (ред.). Прямые методы решения макромолекулярных структур. Дордрехт: Kluwer Academic Publishers. С. 401–411. ISBN   0-7923-4949-0.

Учебники и примеры

• Эванс, Гвиндаф (октябрь 1994 г.). «Метод множественной аномальной дифракции длин волн с использованием синхротронного излучения при оптимальных энергиях рентгеновского излучения: применение в кристаллографии белков». Кандидатская диссертация. Уорикский университет.