Mimiviridae

редактировать
Mimiviridae
Tupanvirus.jpeg
Tupanvirus
Классификация вирусов e
(без рейтинга):Вирус
Область:Вариднавирия
Королевство:Bamfordvirae
Тип:Nucleocytoviricota
Класс:Megaviricetes
Порядок:Imitervirales
Семейство:Mimiviridae
Подсемейства и роды

Mimiviridae является семейством вирусы. Амеба и другие протисты служат естественными хозяевами. Семья делится на 4 подсемейства. Вирусы этого семейства принадлежат к кладе нуклеоцитоплазматического вируса большой ДНК (NCLDV), также называемого гигантскими вирусами.

. Mimiviridae является единственным признанным членом порядка Imitervirales . Phycodnaviridae и Pandoraviridae из Algavirales являются сестринскими группами Mimiviridae во многих филогенетических анализах.

Содержание
  • 1 История
  • 2 Таксономия
  • 3 Структура
  • 4 Жизненный цикл
  • 5 Молекулярная биология
  • 6 Клиническая
  • 7 См. Также
  • 8 Ссылки
  • 9 Внешние ссылки
История

Первый член это семейство, мимивирус, было обнаружено в 2003 году, а первая полная последовательность генома была опубликована в 2004 году. Однако мимивирус Cafeteria roenbergensis virus был изолирован и частично охарактеризован в 1995 году, хотя в то время хозяин был неправильно идентифицирован., и вирус был обозначен как BV-PW1.

Таксономия

Группа: дцДНК

Порядок: Imitervirales

Семейство Mimiviridae в настоящее время разделено на три подсемейства.

  • Одно подсемейство (род Mimivirus, предлагаемые названия: Megavirinae или Megamimivirinae) разделено на три "строки". eages ":
    • A - Группа мимивирусов: включает Acanthamoeba polyphaga Mimivirus, Hirudovirus, Mamavirus, Kroon virus, Terra2, вирус Нимейера, вирус Samba.
    • B - Группа Moumouvirus : включает саудовский мумувирус (он же Moumouvirus monve) и.
    • C - группа вирусов Courdo11: включает, Courdo7, Courdo11, Megavirus chilensis, LBA111, мегавирус озера Повай и Terra1.
Большинство Mimiviridae по всей видимости, относятся к этому подсемейству (мимивирусы).
Иногда его также называют группой I Mimiviridae.

Кроме того, было предложено либо расширить Mimiviridae дополнительной предварительной группой III (подсемейство Mesomimivirinae), либо классифицировать эту группу как сестринскую семейство Mesomimiviridae вместо этого, включающее наследие (группа органических озер Фикодна). Это расширение (или сестринское семейство) может состоять из следующих элементов:

  • (PgV, представленный штаммом PgV-16T) и (PpV, например, PpV 01)
  • «Органический фикоднавирус озера» 1 и 2 (OLV1, OLV2, хозяева вирофага органического озера )
  • «Мимивирус Йеллоустонского озера», также известного как «фикоднавирус Йеллоустонского озера» 4 ()
  • вирус Chrysochromulina ericina (CeV, например, CeV 01)
  • (AaV)
  • (PoV)
  • (TetV-1)

Эта группа, по-видимому, тесно связана с Mimiviridae, а не с Phycodnaviridae и поэтому иногда упоминается в качестве дополнительного кандидата в подсемейство. Иногда расширенное семейство Mimiviridae упоминается как Megaviridae, хотя это не было признано ICTV; в качестве альтернативы расширенная группа может называться просто Mimiviridae.

С признанием ICTV в марте 2020 г. нового порядка Imitervirales больше не нужно расширять семейство Mimiviridae, чтобы оно включало группу вирусов с наблюдаемым высоким разнообразием. Вместо этого расширение (или, по крайней мере, st его основная клада ) может быть отнесена к сестринскому семейству Mesomimiviridae.

Хотя только пара представителей этого отряда были описаны подробно, вероятно, есть еще много других, ожидающих описания и назначение. Неназначенные члены включают вирус Aureococcus anophagefferens (AaV), CpV-BQ2 и Terra2.

Структура
Ультраструктура частиц вируса Bodo saltans и его репликация

Вирусы у Mimiviridae имеют икосаэдрическую и круглую геометрию с симметрией от Т = 972 до Т = 1141, или Т = 1200. Диаметр около 400 нм, длина 125 нм. Геномы бывают линейными и несегментированными, длиной около 1200 килобайт. Геном имеет 911 открытых рамок считывания.

.

РодСтруктураСимметрияГеномное расположениеГеномная сегментация
МимивирусИкосаэдрическийT = 972-1141 или T = 1200 (H = 19 +/- 1, K = 19 +/- 1)ЛинейныйОдночастный
КлоснеувирусИкосаэдрический
КафетерийвирусИкосаэдрическийT = 499ЛинейныйОдносоставный
ТупанвирусХвостатая
Жизненный цикл

Репликация следует модели смещения цепи ДНК. Транскрипция с использованием ДНК-шаблона - это метод транскрипции. Амеба служит естественным хозяином.

РодСведения о хозяинеТропизм тканиСведения о входеСведения о выпускеРепликация сайтСайт сборкиПередача
МимивирусАмёбаНетНеизвестноНеизвестноНеизвестноНеизвестноПассивная диффузия
КлоснейвирусмикрозоопланктонНетНеизвестноНеизвестноНеизвестноЦитоплазмаПассивная диффузия
Вирус кафетериимикрозоопланктонНетНеизвестноНеизвестноНеизвестноЦитоплазмаПассивная диффузия
Молекулярная биология

Внутри генома интегрированного генома Сообщалось о вирофаге (Спутник 2) и трансповироне - мобильном генетическом элементе. Трансповироны представляют собой линейные элементы ДНК размером около 7 тысяч оснований, которые включают от шести до восьми генов, кодирующих белок, два из которых гомологичны генам вирофагов. Широкий спектр мимивирусов вирофаг позволяет выделить его с помощью репортера мимивируса.

Клинические

Мимивирусы связаны с пневмонией, но их значение в настоящее время неизвестно. На сегодняшний день единственным вирусом этого семейства, выделенным от человека, является LBA 111. В Институте Пастера в Иране (Тегеран) исследователи идентифицировали ДНК мимивируса в бронхоальвеолярном лаваже (БАЛ) и образцах мокроты ребенка-пациента, используя ПЦР в реальном времени ( 2018). Анализ показал 99% гомологию LBA111, линии C Megavirus chilensis. Поскольку до этого открытия было зарегистрировано лишь несколько случаев, легитимность мимивируса как развивающегося инфекционного заболевания у людей остается спорным.

Мимивирус также был причастен к ревматоидному артриту.

См. Также
  • icon Портал вирусов
Ссылки
Внешние ссылки
Викивиды содержат информацию, относящуюся к Mimiviridae

Последняя правка сделана 2021-05-30 12:48:50
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте