Mimiviridae | |
---|---|
Tupanvirus | |
Классификация вирусов | |
(без рейтинга): | Вирус |
Область: | Вариднавирия |
Королевство: | Bamfordvirae |
Тип: | Nucleocytoviricota |
Класс: | Megaviricetes |
Порядок: | Imitervirales |
Семейство: | Mimiviridae |
Подсемейства и роды | |
|
Mimiviridae является семейством вирусы. Амеба и другие протисты служат естественными хозяевами. Семья делится на 4 подсемейства. Вирусы этого семейства принадлежат к кладе нуклеоцитоплазматического вируса большой ДНК (NCLDV), также называемого гигантскими вирусами.
. Mimiviridae является единственным признанным членом порядка Imitervirales . Phycodnaviridae и Pandoraviridae из Algavirales являются сестринскими группами Mimiviridae во многих филогенетических анализах.
Первый член это семейство, мимивирус, было обнаружено в 2003 году, а первая полная последовательность генома была опубликована в 2004 году. Однако мимивирус Cafeteria roenbergensis virus был изолирован и частично охарактеризован в 1995 году, хотя в то время хозяин был неправильно идентифицирован., и вирус был обозначен как BV-PW1.
Группа: дцДНК
Порядок: ImiterviralesСемейство Mimiviridae в настоящее время разделено на три подсемейства.
Кроме того, было предложено либо расширить Mimiviridae дополнительной предварительной группой III (подсемейство Mesomimivirinae), либо классифицировать эту группу как сестринскую семейство Mesomimiviridae вместо этого, включающее наследие (группа органических озер Фикодна). Это расширение (или сестринское семейство) может состоять из следующих элементов:
Эта группа, по-видимому, тесно связана с Mimiviridae, а не с Phycodnaviridae и поэтому иногда упоминается в качестве дополнительного кандидата в подсемейство. Иногда расширенное семейство Mimiviridae упоминается как Megaviridae, хотя это не было признано ICTV; в качестве альтернативы расширенная группа может называться просто Mimiviridae.
С признанием ICTV в марте 2020 г. нового порядка Imitervirales больше не нужно расширять семейство Mimiviridae, чтобы оно включало группу вирусов с наблюдаемым высоким разнообразием. Вместо этого расширение (или, по крайней мере, st его основная клада ) может быть отнесена к сестринскому семейству Mesomimiviridae.
Хотя только пара представителей этого отряда были описаны подробно, вероятно, есть еще много других, ожидающих описания и назначение. Неназначенные члены включают вирус Aureococcus anophagefferens (AaV), CpV-BQ2 и Terra2.
Вирусы у Mimiviridae имеют икосаэдрическую и круглую геометрию с симметрией от Т = 972 до Т = 1141, или Т = 1200. Диаметр около 400 нм, длина 125 нм. Геномы бывают линейными и несегментированными, длиной около 1200 килобайт. Геном имеет 911 открытых рамок считывания.
.
Род | Структура | Симметрия | Геномное расположение | Геномная сегментация |
---|---|---|---|---|
Мимивирус | Икосаэдрический | T = 972-1141 или T = 1200 (H = 19 +/- 1, K = 19 +/- 1) | Линейный | Одночастный |
Клоснеувирус | Икосаэдрический | |||
Кафетерийвирус | Икосаэдрический | T = 499 | Линейный | Односоставный |
Тупанвирус | Хвостатая |
Репликация следует модели смещения цепи ДНК. Транскрипция с использованием ДНК-шаблона - это метод транскрипции. Амеба служит естественным хозяином.
Род | Сведения о хозяине | Тропизм ткани | Сведения о входе | Сведения о выпуске | Репликация сайт | Сайт сборки | Передача |
---|---|---|---|---|---|---|---|
Мимивирус | Амёба | Нет | Неизвестно | Неизвестно | Неизвестно | Неизвестно | Пассивная диффузия |
Клоснейвирус | микрозоопланктон | Нет | Неизвестно | Неизвестно | Неизвестно | Цитоплазма | Пассивная диффузия |
Вирус кафетерии | микрозоопланктон | Нет | Неизвестно | Неизвестно | Неизвестно | Цитоплазма | Пассивная диффузия |
Внутри генома интегрированного генома Сообщалось о вирофаге (Спутник 2) и трансповироне - мобильном генетическом элементе. Трансповироны представляют собой линейные элементы ДНК размером около 7 тысяч оснований, которые включают от шести до восьми генов, кодирующих белок, два из которых гомологичны генам вирофагов. Широкий спектр мимивирусов вирофаг позволяет выделить его с помощью репортера мимивируса.
Мимивирусы связаны с пневмонией, но их значение в настоящее время неизвестно. На сегодняшний день единственным вирусом этого семейства, выделенным от человека, является LBA 111. В Институте Пастера в Иране (Тегеран) исследователи идентифицировали ДНК мимивируса в бронхоальвеолярном лаваже (БАЛ) и образцах мокроты ребенка-пациента, используя ПЦР в реальном времени ( 2018). Анализ показал 99% гомологию LBA111, линии C Megavirus chilensis. Поскольку до этого открытия было зарегистрировано лишь несколько случаев, легитимность мимивируса как развивающегося инфекционного заболевания у людей остается спорным.
Мимивирус также был причастен к ревматоидному артриту.
Викивиды содержат информацию, относящуюся к Mimiviridae |