MicF РНК | |
---|---|
Прогнозируемая вторичная структура и сохранение последовательности MicF | |
Идентификаторы | |
Условное обозначение | MicF |
Рфам | RF00033 |
Прочие данные | |
Тип РНК | Джин ; антисмысловой |
Домен (ы) | Бактерии |
ИДТИ | GO: 0006950 GO: 0003729 |
ТАК | ТАК: 0000383 |
Структуры PDB | PDBe |
РНК micF представляет собой некодирующие РНК гена реакция на стресс найдены в кишечной палочки и связанных с ними бактерий, которые посттранскрипционно контролирует экспрессию гена наружной мембраны поринового OmpF. Ген micF кодирует нетранслируемую 93 нуклеотидную антисмысловую РНК, которая связывает свою мРНК- мишень ompF и регулирует экспрессию ompF путем ингибирования трансляции и индукции деградации сообщения. Кроме того, другие факторы, такие как белок-шаперон РНК StpA, также играют роль в этой регуляторной системе. Выражение micF контролируется факторами окружающей среды и внутреннего стресса. Известно, что четыре регулятора транскрипции связывают промоторную область micF и активируют экспрессию micF.
Гомологи РНК MicF были охарактеризованы методом Саузерн-блоттинга для различных бактерий, включая Salmonella typhimurium, Klebsiella pneumoniae и Pseudomonas aeruginosa. MicF также был идентифицирован компьютерным путем у Yersinia pestis и Yersinia enterocolitica.