Хелен Берман | |
---|---|
Хелен Берман в 2008 году. | |
Родилась | Хелен Мириам Берман. 1943 (возраст 76–77). Чикаго, Иллинойс |
Alma mater | |
Супруг (ы) |
|
Дети | Джейсон Ашер Янг |
Награды |
|
Научная карьера | |
Области | |
Учреждения | Университет Рутгерса |
Диссертация | Кристаллические структуры Альфа-Прайм и бета-D-маннит, галактикол, метил-альфа-D-глюкопия ранозид и гидроксимочевина (1967) |
Докторский советник | Джордж А. Джеффри |
Другие научные консультанты | Барбара Лоу |
Веб-сайт | rutchem.rutgers.edu / berman-helen-m |
Хелен Мириам Берман является членом Совета управляющих, профессором химии и химической биологии в Университете Рутгерса и бывшим директором банка данных по белкам RCSB (один организаций, входящих в Worldwide Protein Data Bank ). Как структурный биолог, ее работа включает структурный анализ комплексов белок-нуклеиновая кислота и роль воды в молекулярных взаимодействиях. Она также является основателем и директором базы данных нуклеиновых кислот и руководит базой знаний по структурной геномике Protein Structure Initiative.
Берман родился в Чикаго, штат Иллинойс, и вырос в Бруклине, штат Нью-Йорк. Ее отец Дэвид Бернштейн был врачом, а мать Дороти Бернштейн (урожденная Скупски) вела офисную практику отца. Вдохновленная своим трудолюбивым и ученым отцом, она интересовалась наукой в юном возрасте и планировала стать ученым или врачом. Ее мать, которая активно участвовала в общественной и волонтерской работе, побуждала ее участвовать в общественной деятельности на протяжении всей ее жизни.
В старших классах Берман работал в лаборатории Ингрит Дейруп в Колледже Барнарда. Дейруп призвал Бермана учиться у Барнарда в качестве бакалавра. В колледже она работала в лаборатории Колледжа врачей и хирургов Колумбийского университета с Барбарой Лоу. Там Берман узнал о кристаллографии, которая стала его страстью на всю жизнь. Она окончила Barnard со степенью A.B. по химии в 1964 году.
После колледжа Берман поступила в аспирантуру в Питтсбургский университет, место, которое она выбрала, потому что это было единственное место в стране с отделением кристаллографии и одним из немногих, где кристаллография предлагалась в качестве предмета. Там она работала с Джорджем А. Джеффри над структурой углеводов, получив докторскую степень. в 1967 г. Берман проработал в Университете Питтсбурга еще два года в качестве постдокторского исследования.
В 1969 году Берман переехала в Онкологический центр Фокс Чейз в Филадельфии, где она работала в лаборатории Дженни П. Глускер. прежде чем начать свою собственную независимую исследовательскую программу в качестве преподавателя в 1973 году. В Fox Chase Берман заинтересовалась структурами нуклеиновых кислот и биоинформатикой. Она знала, что логическая организация данных сделает их полезными для самых разных ученых.
В июне 1971 года Берман посетил симпозиум в лаборатории Колд-Спринг-Харбор, где несколько ученых согласились с тем, что данные о растущем числе белковых структур должны храниться в базе данных. Эта встреча привела к созданию банка данных по белкам (PDB) в Брукхейвенской национальной лаборатории.
. В 1989 году Берман переехала в Рутгерс, а в 1992 году вместе с другими учеными она стала соучредителем базы данных нуклеиновых кислот (NDB) для сбора и распространения информации о структуре нуклеиновых кислот. В Rutgers она продолжала изучать нуклеиновые кислоты, их взаимодействие с белками, а также исследовала структуру коллагена в сотрудничестве с Барбарой Бродски и Хорди Белла. С 1992 по 2011 год она внесена в список депонентов 38 структур в PDB, комплексов белок / нуклеиновая кислота и их компонентов (например, 1RUN, 3SSX, 2B1B), фрагментов коллагена (например, 1CGD, 1EI8) и других макромолекул.
В 1998 году Берман и Филип Борн вместе соревновались и выиграли контракт на создание банка данных по белкам, и база данных была переведена из Брукхейвена под эгиду Исследовательского сотрудничества в области структурной биоинформатики (RCSB)., в настоящее время является результатом сотрудничества Рутгерса и Калифорнийского университета в Сан-Диего. Вместе с коллегами Берман переработал систему управления данными, добавил новые пользовательские инструменты и сделал базу данных доступной для поиска. С 2003 года архивом PDB управляет всемирный банк данных Protein (wwPDB) - партнерство, основанное Берманом и состоящее из организаций, которые действуют как центры хранения, обработки и распределения данных PDB - RCSB, PDBe в Европе и PDBj в Японии. В 2006 году банк данных BioMagResData (BMRB) для структур ядерного магнитного резонанса (ЯМР) стал четвертым членом wwPDB. По состоянию на июль 2018 года NDB содержит более 9600 структур нуклеиновых кислот, а PDB - более 142000 макромолекулярных структур.
Также под руководством RCSB весной 2008 года была запущена база знаний по структурной геномике Protein Structure Initiative (PSI), которая обеспечивает постоянно обновляемый портал для данных исследований и других ресурсов PSI.
Берман также был активен в научном сообществе, занимая пост президента Американской кристаллографической ассоциации в 1988 г., консультировал как Национальные институты здравоохранения, так и Национальный научный фонд, а также входил в редколлегию нескольких журналы. Ее работы широко публиковались в рецензируемых научных журналах.
Берман была замужем дважды: за инженером Виктором Берманом в 1960-х годах и за молекулярным биологом Питером Янгом с 1976 по 1999 год. От второго брака у нее есть сын Джейсон Ашер Янг. (1979 г.р.), физик.
В 1980-х у Бермана диагностировали рак груди. Этот опыт сделал ее более сосредоточенной в своей жизни и карьере и заинтересовала в поддержке других женщин, которые сталкиваются с таким же диагнозом.