Войти
транспозоны hAT являются надсемейством Транспозоны ДНК или транспозоны класса II , которые распространены в геномах растений, животных и грибов.
Надсемейства идентифицируются по общей последовательности ДНК a и способность реагировать на ту же транспозазу. Общие характеристики транспозонов hAT включают размер 2,5-5 килобаз с короткими концевыми инвертированными повторами и короткими фланкирующими дупликациями целевого сайта, генерируемыми в процессе транспозиции.
hAT Название суперсемейства происходит от трех его членов: элемента hobo от Drosophila melanogaster, Activator или элемента Ac от Zea mays и элемента Tam3 от Antirrhinum majus. Суперсемейство было разделено на основе анализа биоинформатики, по крайней мере, на два кластера, определяемых их филогенетическими отношениями: семейство Ac и семейство Buster. Совсем недавно была описана третья группа, названная Tip.
Суперсемейство транспозонов hAT включает первый обнаруженный транспозон, Ac из Zea mays (кукуруза ), впервые сообщила Барбара МакКлинток. МакКлинток был удостоен Нобелевской премии по физиологии и медицине в 1983 году за это открытие. Семейство также включает подгруппу, известную как космические захватчики или элементы SPIN, которые имеют очень высокое число копий в некоторых геномах и которые являются одними из наиболее эффективных известных транспозонов. Хотя ни один из существующих активных примеров неизвестен, лабораторно сгенерированные консенсусные последовательности активных элементов SPIN способны генерировать высокое число копий при введении в клетки широкого диапазона видов.
Транспозоны hAT широко распространены в геномах эукариот , но не активны во всех организмах. Последовательности неактивных транспозонов hAT присутствуют в геномах млекопитающих, включая геном человека ; они относятся к семействам транспозонов, которые, как считается, присутствовали в геноме предковых позвоночных. Среди млекопитающих геном маленькой коричневой летучей мыши Myotis lucifugus отличается относительно высоким и недавно приобретенным количеством неактивных транспозонов hAT.
Распределение элементов SPIN неоднородно и не имеет отношения хорошо известных филогенетических взаимосвязей, что наводит на мысль о том, что эти элементы могли распространиться посредством горизонтального переноса генов.
Транспозоны считаются эксапированными или «одомашненными», когда они приобрели функциональные роли в геноме хозяина. Несколько последовательностей, эволюционно родственных семейству hAT, были обнаружены у различных организмов, включая Homo sapiens. Примером может служить семейство генов ZBED, которые кодируют группу регуляторных белков, содержащих цинковый палец.
