Эукариотический фактор инициации 4F (eIF4F ) представляет собой гетеротримерный белковый комплекс, который связывает 5 'cap из информационные РНК (мРНК), способствующие инициации эукариотической трансляции. Комплекс eIF4F состоит из трех неидентичных субъединиц: DEAD-box РНК-геликазы eIF4A, кэп-связывающего белка eIF4E и большой белок «каркаса» eIF4G. Комплекс eIF4F у млекопитающих был впервые описан в 1983 году и с тех пор является основной областью изучения молекулярных механизмов кэп-зависимой инициации трансляции.
eIF4F важна для рекрутирования малой рибосомной субъединицы (40S) в 5 'cap мРНК во время cap-зависимой инициации трансляции. Компоненты комплекса также участвуют в независимой от кэпа инициации трансляции; например, некоторые вирусные протеазы расщепляют eIF4G для удаления области связывания eIF4E, тем самым ингибируя кэп-зависимую трансляцию.
Структуры компонентов eIF4F были решены индивидуально и в виде частичных комплексов с помощью существует множество методов, но полная структура eIF4F в настоящее время недоступна.
У млекопитающих тримерный комплекс eIF4E • G • A может быть непосредственно очищен из клеток, в то время как только две субъединицы eIF4E • G можно очистить из дрожжевых клеток. eIF4E связывает mG 5 'cap и каркас eIF4G, соединяя 5' конец мРНК с центром других факторов инициации и мРНК. Считается, что взаимодействие eIF4G • A направляет формирование посадочной площадки одноцепочечной РНК для преинициативного комплекса 43S (43S PIC) посредством активности eIF4A РНК-геликазы.
Белки eIF4F взаимодействуют с рядом различных партнеров по связыванию, и в геноме человека существует несколько генетических изоформ eIF4A, eIF4E и eIF4G.. У млекопитающих eIF4F соединяется с рибосомной субъединицей 40S посредством eIF3 через eIF4G, тогда как у почкующихся дрожжей эта связь отсутствует. Считается, что взаимодействия между eIF4G и PABP опосредуют циркуляризацию частиц мРНК.
Субъединица | MW (кДа) | Изоформы | Основные характеристики |
---|---|---|---|
eIF4A | 46 | eIF4A1, eIF4A2, eIF4A3 | DEAD-box РНК-геликаза. Связывает мРНК, eIF4G, eIF4B, eIF4H и PDCD4. Ингибируется небольшими молекулами гиппуристанолом, рокагламидом A (RocA) и патеамином A. |
eIF4E | 25 | eIF4E1, eIF4E2, eIF4E3 | Cap-связывающий белок. Связывает eIF4G, 4EBP1, 4EBP2 и 4EBP3. |
eIF4G | 175 | eIF4G1, eIF4G3 | белок «каркас». Связывает мРНК, eIF4A, eIF4E и PABP. |
Приблизительная молекулярная масса белков человека.
В дополнение к основным белкам, включающим тример eIF4F, комплекс eIF4F функционально взаимодействует с белками, включая eIF4B и eIF4H. Необычная изоформа eIF4G, eIF4G2 или DAP5, также, по-видимому, выполняет неканоническую функцию трансляции.
Субъединица eIF4E eIF4F является важной мишенью для передачи сигналов mTOR через связывающий белок eIF4E (4E-BP). Фосфорилирование 4E-BP с помощью mTOR предотвращает их связывание с eIF4E, освобождая eIF4E для связывания eIF4G и участия в инициации трансляции.