Дэвид Бейкер | |
---|---|
Дэвид Бейкер на вершине Spark Plug Mountain, Вашингтон, 31 июля 2013 г. | |
Родился | (1962-10-06) 6 октября 1962 г. (возраст 58) |
Alma mater | |
Известен по | |
Супруг (ы) | Ханнеле Руохола-Бейкер |
Награды | |
Научная карьера | |
Филдс | компьютерный биолог |
Учреждения | |
Советник по докторантуре | Рэнди Шекман |
Другие научные консультанты | Дэвид Агард |
Докторанты | Ричард Бонно |
Другие известные студенты | Брайан Кульман, Таня Кортемме |
Веб-сайт | www.bakerlab.org |
Дэвид Бейкер (родился 6 октября 1962 года в Сиэтле, штат Вашингтон) - американский биохимик и компьютерный биолог, который первым изобрел методы предсказания и спроектировать трехмерные структуры белков. Он является дипломированным профессором биохимии Генриетты и Обри Дэвис и адъюнкт-профессором генома, биоинженерии, химической инженерии, информатики и физики в Вашингтонском университете. Он является директором Rosetta Commons, консорциума лабораторий и исследователей, которые разрабатывают программное обеспечение для прогнозирования и проектирования биомолекулярной структуры. Он является исследователем Медицинского института Говарда Хьюза и членом Национальной академии наук США. Он также является директором Вашингтонского университета.
Бейкер получил диплом по биохимии в Калифорнийском университете в Беркли в лаборатории Рэнди Шекман, где он преимущественно занимался транспортом белка и торговлей дрожжами. Он работал над докторской диссертацией с Дэвидом Агардом из Калифорнийского университета в Сан-Франциско.
За свою работу по фолдингу белков Бейкер получил Международную премию Саклера в области биофизики в 2008 году, а в 2021 году - Премия «Прорыв в науках о жизни».
Бейкер был избран членом Американской академии искусств и наук в 2009 году. Он женат на Ханнеле Руохола-Бейкер, еще одном биохимике из UW. У них двое детей.
Группа Бейкера разработала алгоритм Розетты для ab initio предсказания структуры белка, который был расширен до проекта распределенных вычислений под названием Rosetta @ Home и Foldit. Проект направлен на создание структурных моделей для белковых комплексов, а также отдельных полипептидных цепей. Группа специализируется на эксперименте по предсказанию структуры CASP с использованием методов ab initio, включая как ручные, так и автоматизированные варианты протокола Rosetta.
Члены его группы активны в области белковый дизайн ; они известны тем, что разработали белок, известный как Top7, с совершенно новой структурой.
Хотя он в первую очередь известен разработкой методов компьютерного прогнозирования структуры и функции белка, он также заинтересован в использовании вычислительных методов для экспериментальной оценки биологии; его лаборатория поддерживает активную группу экспериментальной биохимии.
В декабре 2018 года Бейкер выступил на конференции «Разработка антител и терапия» в Сан-Диего, Калифорния.
В апреле 2019 года Бейкер выступил на TED с докладом под названием « 5 задач, которые мы могли бы решить, создавая новые белки »на TED2019 в Ванкувере, Канада.