При обращении к транскрипции ДНК, кодирующая цепь представляет собой цепь ДНК, последовательность оснований которой соответствует последовательности оснований полученного транскрипта РНК (хотя тимин заменен на урацил ). Именно эта цепь содержит кодоны, а некодирующая цепь содержит антикодоны. Во время транскрипции РНК Pol II связывается с некодирующей цепью, считывает антикодоны и транскрибирует их последовательность для синтеза транскрипта РНК с комплементарными основаниями.
По соглашению, кодирующая цепь - это цепь, используемая при отображении последовательности ДНК. Он представлен в направлении 5 'к 3'.
Везде, где ген существует в молекуле ДНК , одна цепь является кодирующей цепью (или смысловая цепь ), а другая - некодирующая цепь (также называемая антисмысловой цепью, антикодирующей цепью, матричной цепью или транскрибированная нить ).
Во время транскрипции, РНК-полимераза раскручивает короткий участок ДНК двойной спирали рядом с начало гена (сайт начала транскрипции). Этот развернутый раздел известен как пузырь транскрипции. РНК-полимераза, а вместе с ней и пузырь транскрипции, перемещается по некодирующей цепи в противоположном направлении, от 3 'до 5', а также полимеризует вновь синтезированную цепь от 5 'до 3' или ниже по течению направление. Двойная спираль ДНК перематывается РНК-полимеразой в задней части пузыря транскрипции. Подобно тому, как работают две соседние молнии, когда они стянуты вместе, они распаковываются и повторно застегиваются по мере продвижения в определенном направлении. Различные факторы могут вызывать разрыв двухцепочечной ДНК; таким образом, переупорядочивают гены или вызывают гибель клеток.
Если спираль разматывается, кодирующая цепь состоит из неспаренных оснований, а матричная цепь состоит из композита РНК: ДНК, за которым следует ряд непарных баз в тылу. Этот гибрид состоит из последних добавленных нуклеотидов транскрипта РНК, комплементарных оснований, спаренных с цепью матрицы. Количество пар оснований в гибриде изучается, но было высказано предположение, что гибрид образован из последних 10 добавленных нуклеотидов.