Войти
Непрерывная автоматическая оценка модели (CAMEO) проект для всего сообщества по непрерывной оценке точности и надежности серверов предсказания структуры белка полностью автоматизированным способом. CAMEO - это непрерывное и полностью автоматизированное дополнение к проводящемуся раз в два года эксперименту CASP. В настоящее время CAMEO оценивает предсказания для предсказанных трехмерных белковых структур (3D), предсказаний сайта связывания лиганда в белках (LB) и инструментов оценки качества модели (QE).
CAMEO выполняет слепую оценку белка методы прогнозирования структуры, основанные на еженедельных выпусках новых экспериментальных структур, полученных с помощью банка данных белков (PDB). аминокислотные последовательности белковых структур, которые вскоре будут выпущены, отправляются на участвующие веб-серверы. Веб-серверы возвращают свои прогнозы в CAMEO, и прогнозы, полученные до выпуска экспериментальных структур, включаются в оценку точности прогнозов. В отличие от эксперимента CASP, сравнение между прогнозируемыми и справочными данными полностью автоматизировано и, следовательно, требует численных мер расстояния, устойчивых к относительным перемещениям домена.
CAMEO был разработан как часть модуля Базы знаний по структурной биологии в рамках Инициативы по структуре белка. Более ранними проектами с аналогичными целями были EVA и LiveBench. CAMEO разрабатывается группой вычислительной структурной биологии SIB Швейцарского института биоинформатики и Biozentrum Базельского университета.
