Православная церковь Брахмавара (Конкани) - это фракция, отколовшаяся от католической церкви, сформированная под руководством епископа Антонио Франсиско Ксавье Альварес в 1889 году.
Территория Гоа была тогда португальской колонией. Антонио Альварес, который был римско-католическим священником в то время, выступал против политики Ватикана и вмешательства правительства в церковное управление. Его периодические издания, выступающие за независимость, которые также критиковали Римско-католическую церковь, были запрещены. Его отлучили от церкви, раздели догола и провели по улицам. Он покинул Церковь с несколькими сотнями католических семей Гоа и присоединился к Православной церкви Маланкара, и с тех пор возникла община Брахмавар (Конкани) как часть Индийской Православной Церкви.
Антонио Франсиско Ксавьер Альварес был рукоположен в качестве первого православного митрополита Гоа, Цейлона и Великой Индии в 1889 году нашей эры Гиваргезе Мар Грегориосом Парумальским в Православной духовной семинарии в Коттаям в штате Кералы.
В настоящее время они находятся в ведении Брахмаварской епархии Маланкарской (Индийской) Православной церкви.