Биомоделирование - это математическое моделирование биологических процессов и систем с помощью компьютера, которое является неотъемлемой частью системной биологии. Из-за сложности биологических систем часто используются упрощенные модели, которые должны быть настолько сложными, насколько это необходимо.
Целью биомоделирования является прогнозирование поведения и динамики биологических систем на основе моделей, например реакция органа или отдельной клетки на химическое вещество. Однако качество прогнозов на основе моделей сильно зависит от качества модели, которое, в свою очередь, определяется качеством данных и глубиной знаний.
Биосимуляция становится все более важной для разработки лекарств. Поскольку в среднем только 11% всех лекарств-кандидатов одобряются, ожидается, что биосимуляция может быть инструментом для прогнозирования того, не удастся ли лекарство-кандидат потерпеть неудачу в процессе разработки, например в клинических исследованиях из-за побочных эффектов, плохой фармакокинетики или даже токсичности. Раннее предсказание того, что лекарство не подействует на животных или людей, будет ключом к сокращению как затрат на разработку лекарств, так и количества необходимых экспериментов на животных и клинических испытаний. Последнее также соответствует так называемым «3R», которые относятся к принципу r извлечения и r замены экспериментов на животных, а также к r совершенствование методологии в случаях, когда все еще необходимы испытания на животных. В будущем биосимуляция изменит способ тестирования веществ, в котором тесты in vivo и in vitro заменяются тестами in silico.
из-за важности биомоделирования при разработке лекарств существует ряд исследовательских проектов, направленных на моделирование метаболизма, токсичности, фармакодинамики и фармакокинетики кандидата на лекарство. Некоторые из исследовательских проектов перечислены ниже:
Более того, уже существует несколько программных инструментов, предназначенных для прогнозирования токсичности вещества или даже попробуйте смоделировать виртуального пациента (Entelos). Некоторые из этих программных инструментов перечислены ниже: