TreeBASE является хранилищем филогенетические данные, опубликованные в научных журналах. В филогенетических исследованиях собираются или генерируются исследовательские данные, такие как сравнительные наблюдения (например, матрицы состояний символов или множественные выравнивания последовательностей ), сделанные на наборе таксонов, метаданные об этих таксонах и филогенетические деревья, которые, как предполагается, наилучшим образом описывают эволюционные отношения между таксонами.
Цель проекта TreeBASE - предоставить стабильные записи и идентификаторы для этих данных, чтобы другие сотрудники могли ссылаться на свои депонированные данные в своей публикации, а другие ученые могли найти данные и использовать их для проверки оригинального исследования или для включения или расширения их в дальнейшем анализе.
Проект был начат в 1994 году при финансировании из США Национального научного фонда. После этого прототипа был инициирован редизайн в рамках проекта CIPRES. Эта новая версия была выпущена в марте 2010 г. и поддерживалась, в частности, проектом pPOD, который профинансировал добавление интерфейса веб-службы RESTful с возможностями поиска CQL и Национальный центр эволюционного синтеза (NESCent), в котором размещены база данных и веб-сервер.
Зимой 2010 года TreeBASE была реорганизована и стала ассоциироваться с
.