Уганда имеет длинный и, до относительно недавнего времени довольно снисходительная история ЛГБТ. В доколониальные времена с «мудоко дако » или женоподобными мужчинами среди ланги северной Уганды обращались как с женщинами и могли жениться на мужчинах. Религиозные роли мужчин, переодевающихся в переодевание (гомосексуальные священники), исторически встречались среди людей буньоро. Люди Тесо также признали категорию мужчин, которые одевались как женщины.
В Буганде, одном из крупнейших традиционных королевств Уганды, существуют определенные формы однополых мужчин. отношения были институционализированы. Молодые люди служили при королевских дворах и оказывали сексуальные услуги посетителям и элите. Не секрет, что Кабака Мванга II, правивший во второй половине XIX века, был бисексуалом. Гомосексуализм в Уганде был криминализован в 1902 году.
В феврале 2014 года президент Йовери Мусевени подписал новый закон, Закон Уганды о борьбе с гомосексуализмом, который предусматривает более жесткие наказания для геев, в том числе криминализирует людей, которые не сообщают о них. Новый закон также впервые коснулся лесбиянок. Однако 1 августа 2014 года Конституционный суд Уганды признал новый закон недействительным.