Войти
Гэри Сиуздак - американский химик, наиболее известный своими работами в области метаболомики, метаболомики активности и масс-спектрометрии. В настоящее время он является профессором и директором Центра метаболомики и масс-спектрометрии в Scripps Research в Ла-Хойя, Калифорния. Сюздак также внес вклад в анализ вирусов, вирусную структурную динамику, а также в разработку технологии получения изображений масс-спектрометрии с использованием наноструктурированных поверхностей. Лаборатория Сюздака также отвечает за создание исследовательских инструментов XCMS, METLIN и EISA.
Сюздак изучал химию (BS) и прикладную математику (BA) в Род-Айленде. Колледж. Затем он поступил в Дартмутский колледж для получения диплома, где построил свой первый масс-спектрометр для проведения экспериментов по масс-спектрометрии с многофотонной ионизацией и иногда для участия в соревнованиях по пауэрлифтингу. В Дартмуте он получил докторскую степень по физической химии (29 марта 1990 г.), а 1 апреля 1990 г. начал работу в Scripps Research. В 2017 году Сюздак также получил почетную докторскую степень (с Эммануэль Шарпантье ) от Университета Умео за свою работу в метаболомике. Сюздак имеет сотни статей и является автором двух книг: «Масс-спектрометрия для биотехнологии» (1996 г.) и «Расширяющаяся роль масс-спектрометрии в биотехнологии» (2003 г.), а также «Расширяющаяся роль масс-спектрометрии в биотехнологии», 2-е изд. (2006).
С 1994 года и по настоящее время лаборатория Сюздак работает над деятельностью метаболомикой. с помощью метаболомики на основе масс-спектрометрии с жидкостной хроматографией для идентификации метаболитов, изменяющих фенотип. В их первоначальных усилиях с Ричардом Лернером использовалась масс-спектрометрия с жидкостной хроматографией для проведения метаболомных экспериментов с церебральной спинномозговой жидкостью лишенных сна животных. цис-9,10-октадеценоамид, новый липид гормон (также известный как олеамид ), и было показано, что он спит побуждающие свойства. Эта работа - один из самых ранних подобных экспериментов, сочетающих жидкостную хроматографию, масс-спектрометрию и метаболомику для идентификации активных метаболитов. Другое примечательное мероприятие метаболомика с Оскаром Янесом (Испания) выявило нейропротектин D1 как метаболит, который способствует дифференцировке стволовых клеток.
В 1996 году был проведен анализ всего вируса с помощью масс-спектрометра с ионизацией электрораспылением, где вирус был собран и успешно протестирован на жизнеспособность. Позже он и его сотрудники представили первый пример целого неповрежденного вируса (вирус табачной мозаики), масса которого была измерена с помощью масс-спектрометра с определением заряда - прибора, разработанного Генри Беннером и Стивеном Фюрстенау из Национальной лаборатории Лоуренса Беркли.
В 1999 году лаборатория Siuzdak описала использование наноструктур для усиления десорбции / ионизации на пористом кремнии малых молекул (DIOS ), это также известно как первый пример поверхностной лазерной десорбции. / ионизационная масс-спектрометрия (SALDI-MS). В дальнейшем эта технология была расширена за счет использования фторированных молекул инициатора, используемых в пористом кремнии, и была описана как масс-спектрометрия инициатора наноструктуры (NIMS), также известная как масс-спектрометрия для визуализации наноструктур (NIMS) из-за ее расширенного применения для визуализации.
В 2005 году лаборатория Siuzdak занималась определением пиков дисрегулируемого метаболизма из наборов данных масс-спектрометрии с жидкостной хроматографией, для решения проблемы согласования времени удерживания они разработали первый алгоритм, который позволил нелинейное согласование данные метаболомики под названием XCMS.
С начала 2000-х годов и по настоящее время лаборатория Сюздак создала и расширяет базу данных тандемной масс-спектрометрии, известную как METLIN. METLIN состоит исключительно из экспериментальных данных, полученных с помощью тандемных масс-спектрометрических приборов высокого разрешения, все данные получены из молекулярных стандартов. В настоящее время METLIN имеет более 850 000 молекулярных стандартов с данными экспериментальной тандемной масс-спектрометрии. METLIN уникален в отношении своего размера, поскольку другие базы данных более чем на порядок меньше, и он также уникален, потому что весь тандем METLIN Данные масс-спектрометрии систематически генерировались при нескольких энергиях столкновения и в режимах положительной и отрицательной ионизации.
В 2020 году лаборатория Siuzdak, опираясь на свою работу с Хави Доминго и METLIN, разработала усовершенствованную внутреннюю фрагментацию / аннотацию (EISA) для облегчения фрагментации, идентификации и количественной оценки молекул. без использования тандемной масс-спектрометрии.
