Войти
 | |
|---|---|
| Содержимое | |
| Описание | DisProt содержит информацию и аннотацию беспорядка во внутренне неструктурированных белках. |
| Типы данных. захваченные | Аннотации внутренне неструктурированных белков |
| Организмы | Все |
| Связаться с | |
| Исследовательский центр | Департамент биомедицинских наук в Университете Падуи |
| Первичное цитирование | PMID 31713636 |
| Дата выпуска | Сентябрь 2019 г. |
| Доступ | |
| Формат данных | CVS и JSON |
| Веб-сайт | [1] |
| URL-адрес загрузки | [2] |
| Веб-сервис URL | REST API см. Информацию здесь |
| Разное | |
| Лицензия | CC-BY |
| Версия | 8.0 |
| Политика курирования | Да, лечение вручную из литературы |
В молекулярной биологии, DisProt - это курируемая биологическая база данных коллекция внутренне неструктурированных белков. Это ресурс сообщества, содержащий аннотации белковых последовательностей для регионов с внутренними нарушениями из литературы. DisProt классифицирует внутренние нарушения на основе экспериментальных методов и трех онтологий для молекулярных функций, переходов и партнеров по связыванию.
Исторически изучению неупорядоченных белков препятствовало отсутствие организованного ресурса, объединяющего их и их свойства. Выпуск 7 DisProt содержит информацию о более чем 800 белках. Каждая запись белка в DisProt характеризуется идентификатором DisProt, который принимает форму префикса DP, за которым следует идентификатор белка из 5 цифр. Например, DP00016 относится к белку ингибитора 1 циклин-зависимой киназы. Выпуск 8 DisProt содержит более 1400 однозначных записей и более 3000 неупорядоченных участков белка. DisProt 8 также представил концепцию стабильного идентификатора региона DisProt. DisProt широко используется для обучения программным методам предсказания неупорядоченных участков в белках. Кроме того, DisProt использовался для понимания свойств внутренне неструктурированных белков.
Веб-сайт DisProt предоставляет пользователям интерфейс для поиска по ключевым словам, свободному тексту или по сходству последовательностей с помощью ВЗРЫВ. Пользователи также могут просматривать записи (белки или регионы) по их идентификатору, методу обнаружения или идентификатору PubMed. Полный набор данных можно загрузить с веб-сайта в формате CSV или JSON.
Веб-сервер DisProt предоставляет некоторые конечные точки RESTful, позволяющие программный доступ к DisProt и извлечение различных типов данных. Доступные маршруты GET обеспечивают доступ ко всем доступным данным по идентификатору DisProt, списку записей данного типа или списку функциональных терминов, используемых для аннотации DisProt.
