Азовская флотилия или Азовская военная флотилия была именем, данное в нескольких российских военно - морских сил, работающих на Азовском море в составе Императорского русского военно - морского флот, оба Советов и белогвардейцы во время гражданской войны в России, и в рамках Совета Военно-морской флот во время Второй мировой войны.
Впервые флотилия была сформирована в 1768 году для русско-турецкой войны (1768–1774) под командованием вице-адмирала Алексея Сенявина. В 1783 году он был расформирован, а его корабли переданы Черноморскому флоту.
Во время Гражданской войны в России большевики сформировали флотилию в апреле 1918 года для борьбы с немцами и белогвардейцами. Уже в конце июня флотилия была уничтожена после потери береговой линии Азовского моря, а экипажи были переданы Красной Армии. После поражения Деникина в марте 1920 г. Красная Армия отбила побережье Азовского моря, и флотилия вновь была сформирована под командованием С. Е. Маркелова и базировалась в Мариуполе. Все корабли, которые находились в портах Азовского моря, входили в состав флота. Баржи и буксиры были переоборудованы в военные корабли. С сентября по ноябрь база theflotilla была перенесена в Таганрог, а через короткое время вернулась в Мариуполь.
В июле 1920 г. в состав флотилии входили:
Для десантных операций была задействована дивизия численностью 4600 человек. В задачи флотилии входили, например, огневая поддержка войск или создание минных заграждений в Керченском проливе. Она также сыграла важную роль в разгроме войск генерала Врангеля. В апреле 1921 года флотилия была расформирована, а экипажи и корабли были переданы Черноморскому флоту.
Во время Второй мировой войны флотилия сражалась против немецких и румынских войск, продвигавшихся вдоль побережья. После того, как 8 августа 1942 года румынская кавалерия прогнала ее со своей базы в Ейске, флотилия перегруппировалась в Темрюке. В конце августа, когда румынские войска захватили порты Анапа и Темрюк, 23 августа в Темрюке была затоплена большая часть флотилии, включая ее основные боевые корабли: три канонерские лодки ( Буг, Дон и Днестр) водоизмещением 840 тонн каждая и двумя 130-мм орудия.
3 февраля 1943 года флотилия была воссоздана, и штаб-квартирой флотилии стал Ейск. На тот момент флотилия состояла из:
В составе флотилии была создана Ахтарская боевая дивизия, в которую входили батальон морской пехоты, пехотный батальон и четыре зенитные батареи. В состав флотилии также входили 20 «Неман» Р-10, 12 «Ильюшин» Ил-2, истребительная эскадрилья из семи Ил-2 и летно-разведывательная эскадрилья из пяти МБР-2 им. Бериева.
Флотилия поддерживала различные десантные операции и участвовала в освобождении Мариуполя и Таманского полуострова. В ходе Керченско-Эльтигенской операции корабли флотилии высадили войска 56-й армии северо-восточнее Керчи. В январе 1944 года на побережье Крыма было совершено еще три тактических десанта. С ноября 1943 года по апрель 1944 года флотилия выполняла задачи по снабжению Отдельной береговой армии в районе Керчи. В Крымской битве они перебросили войска в Крым и высадили десант на флангах немецкого врага.
В апреле 1944 года из Азовской флотилии была сформирована Дунайская флотилия, которую расформировали.