Закон об Алигархском мусульманском университете был принят в 1920 году имперским законодательством. В 1951 году в этот закон были внесены поправки, направленные на уничтожение исламского учения. В 1967 году в закон были внесены поправки, которые были оспорены в деле Азиза Баши. В 2005 году Высокий суд Аллахабада отменил Закон 1981 года о внесении поправок в Закон о мусульманском университете Алигарха, что является неконституционным и что AMU не является учреждением меньшинства, и, следовательно, уведомление, выданное Министерством развития человеческих ресурсов в феврале разрешение университету зарезервировать места для мусульман в послевузовских медицинских курсах было незаконным.
Закон более или менее находится в центре внимания из-за дебатов о том, Алигархский мусульманский университет был статусом меньшинства или нет? Он находится на рассмотрении Верховного суда Индии. АМУ был объявлен институтом меньшинства Законом о внесении поправок в АМУ в 1981 году Парламентом. В 2005 году Высокий суд Аллахабада постановил, что Закон о поправках к САМ 1981 года является неконституционным. Тогдашнее правительство УПА подало апелляцию в Верховный суд. Однако Правительство NDA отозвало это в 2016 году.