Африканская внутренняя миссия была основана в Кении в 1885 году, а затем переехала в Демократическую Республику Конго. Африканская внутренняя миссия начала работать в Судане в 1949 году.
В хорошем понимании с англиканской церковью в Судане церковь согласилась взять на себя ответственность за весь восточный регион. Экватория. Быстро растущие церкви сконцентрировались на западном берегу Нила.
Первый суданский пастор был рукоположен в 1956 году, а в 1972 году деноминация стала полностью автономной. Церковь находится в Южном Судане, но также присутствует в Судане. В его составе 125 000 членов в 340 общинах.
Член Всемирного сообщества реформатских церквей.