Репрессор Trp | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ленточная диаграмма белка trpR | |||||||||
Идентификаторы | |||||||||
Символ | Trp_repressor | ||||||||
Pfam | PF01371 | ||||||||
Pfam clan | CL0123 | ||||||||
InterPro | IPR000831 | ||||||||
SCOPe | 2wrp / SUPFAM | ||||||||
|
репрессор оперона Trp | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||
Организм | Escherichia coli | ||||||
Символ | trpR | ||||||
Entrez | 948917 | ||||||
RefSeq (Prot) | NP_418810 | ||||||
UniProt | P0A881 | ||||||
Другие данные | |||||||
Хромосома | геном: 4,63 - 4,63 МБ | ||||||
|
Репрессор триптофана (или репрессор trp ) - это фактор транскрипции, участвующий в контроле аминокислоты метаболизм. Лучше всего его изучили на Escherichia coli, где он представляет собой димерный белок, регулирующий транскрипцию 5 генов триптофанового оперона. Когда в клетке много аминокислоты триптофан, она связывается с белком, что вызывает конформационные изменения в белке. Затем репрессорный комплекс связывается со своей операторной последовательностью в генах, которые он регулирует, отключая гены.
Один из генов, регулируемых репрессором trp, кодирует сам репрессорный белок триптофана. Это форма регулирования обратной связи. Однако эти гены расположены на разных оперонах.
Репрессор (триптофана) представляет собой гомодимер белка 25 кДа , который регулирует транскрипцию пути биосинтеза триптофана в бактериях. Есть 5 оперонов, которые регулируются trpR: опероны trpEDCBA, trpR, AroH, AroL и mtr.
Когда аминокислота триптофан находится в избытке в клетке, trpR связывает 2 молекулы триптофана, что изменяет его структуру и динамику, так что она становится способной для связывания с оператором ДНК. Когда это происходит, транскрипция ДНК предотвращается, подавляя продукты гена - белки, которые производят больше триптофана. Когда клеточные уровни триптофана снижаются, молекулы триптофана на репрессоре отпадают, позволяя репрессору вернуться в свою неактивную форму.
trpR также контролирует регуляцию собственной продукции посредством регуляции гена trpR.
Структура связанного с лигандом холорепрессора и безлигандных форм были определены с помощью рентгеновской кристаллографии и ЯМР.
. Оперон trp состоит из регуляторного гена, промотора, оператора и терминатора. Оперон trp активен только при дефиците клеточного триптофана. Если триптофана недостаточно, белок-репрессор отрывается от оператора (где репрессор обычно связан), и РНК-полимераза может завершить считывание цепи ДНК. Если РНК-полимераза достигает терминатора (на конце цепи ДНК), ферменты биосинтеза триптофана экспрессируются.