Войти
| ионный канал TRPA1 | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||||
| Символ | TRP-CC | ||||||||||
| Pfam | PF00520 | ||||||||||
| InterPro | IPR005821 | ||||||||||
| SMART | SM00248 | ||||||||||
| ПРОФИЛЬ | PS50088 | ||||||||||
| TCDB | 1.A.4 | ||||||||||
| OPM белок суперсемейства | 8 | ||||||||||
| OPM | 3j9p | ||||||||||
| |||||||||||
переходный канал Ca рецептора (TRP-CC ) Семейство (TC # 1.A.4 ) является членом суперсемейства потенциал-управляемых ионных каналов (VIC) и состоит из катионных каналов, сохраненных от червей до человека. Семейство TRP-CC также состоит из семи подсемейств (TRPC, TRPV, TRPM, TRPN, TRPA, TRPP и TRPML) на основе гомологии их аминокислотных последовательностей:
Репрезентативный список членов, принадлежащих к семейству TRP-CC, можно найти в классификации транспортеров. База данных.
Члены семейства TRP-CC характеризуются как клеточные сенсоры с полимодальными свойствами активации и стробирования. Многие каналы TRP активируются множеством различных стимулов и функционируют как интеграторы сигналов. Эти белки млекопитающих сведены в таблицу, в которой показаны их общепринятые обозначения, активаторы и ингибиторы, предполагаемые взаимодействующие белки и предполагаемые функции. Членами-основателями суперсемейства TRP являются каналы TRPC (TRP canonical), которые могут активироваться после стимуляции фосфолипазы С и / или истощения внутренних запасов кальция. Однако точные механизмы, приводящие к активации TRPC, остаются неясными. Каналы TRPC регулируют никотин-зависимое поведение.
Один член семейства TRP-CC, TRP-PLIK (1862 aas; AF346629), участвует в регуляции клеточного деления. Он имеет N-концевую последовательность, подобную TRP-CC, и последовательность, подобную C-концевой протеинкиназе. Было показано, что он аутофосфорилирует и проявляет зависимую от фосфорилирования АТФ, неселективную, Ca-проницаемую, выпрямляющую наружу проводимость. Другой длинный гомолог, меластатин, связан с прогрессированием меланоцитарной опухоли, тогда как другой гомолог, MTR1, связан с синдромом Беквита-Видемана и предрасположенностью к неоплазии. Каждый из этих белков может присутствовать в клетке в виде нескольких вариантов сплайсинга.
Способность определять колебания влажности имеет решающее значение для многих животных. Птицы, рептилии и насекомые предпочитают определенную влажность, которая влияет на их спаривание, воспроизводство и географическое распространение. Из-за большого отношения площади поверхности к объему насекомые особенно чувствительны к влажности, и ее обнаружение может повлиять на их выживание. У насекомых существуют два типа гигрорецепторов: один реагирует на повышение (влажный рецептор), а другой - на уменьшение (сухой рецептор) влажности. Хотя предыдущие данные показали, что механочувствительность может вносить вклад в гигросенсибилизацию, клеточная основа гигросенсибилизации и гены, участвующие в определении влажности, остаются неизвестными. Чтобы лучше понять молекулярные основы измерения влажности, исследовали несколько генов, кодирующих каналы, связанные с механочувствительностью, термочувствительностью или переносом воды.
Обобщенная транспортная реакция, катализируемая членами семейства TRP-CC, является :
Ca (на выходе) ⇌ Ca (на входе)
или
C и Ca (на выходе) ⇌ C и Ca (на входе).
Большинство местных анестетиков, используемых в клинической практике, представляют собой относительно гидрофобные молекулы, которые получают доступ к своему блокирующему участку на натриевом канале, диффундируя внутрь или через клеточную мембрану. Эти анестетики блокируют натриевые каналы и возбудимость нейронов. Биншток и др. (2007) протестировали возможность того, что возбудимость первичных сенсорных ноцицепторных (чувствительных к боли) нейронов может быть заблокирована путем введения заряженного, непроницаемого для мембран производного лидокаина QX-314 через поры ядовитого -тепла- чувствительный канал TRPV1 (TC # 1.A.4.2.1 ). Они обнаружили, что заряженные блокаторы натриевых каналов могут быть нацелены на ноцицепторы путем применения агонистов TRPV1 для создания местной анестезии, специфичной для боли. QX-314, применяемый наружно, не оказывал влияния на активность натриевых каналов в небольших сенсорных нейронах при применении отдельно, но при применении в присутствии капсаицина, агониста TRPV1, QX-314 блокировал натриевые каналы и подавлял возбудимость. Структура
Члены VIC (TC № 1.A.1 ), RIR-CaC (TC № 2.A.3 ) и TRP-CC ( TC # 1.A.4 ) семейства имеют схожие структуры трансмембранных доменов, но очень разные структуры цитозольных доменов.
Белки семейства TRP-CC демонстрируют одинаковую топологическую организацию с вероятной Трехмерная структура типа KscA. Они состоят из примерно 700-800 (VR1, SIC или ECaC) или 1300 (белки TRP) аминоацильных остатков (aas) с шестью трансмембранными гаечными ключами (TMS), а также короткой гидрофобной «петлевой» области между TMS 5 и 6. Это область петли может погружаться в мембрану и вносить вклад в путь проникновения ионов.
Все члены ваниллоидного семейства TRP-каналов (TRPV) имеют N-концевой анкириновый повтор домен (ARD), который регулирует усвоение кальция и гомеостаз. Это важно для сборки и регулирования каналов. Кристаллическая структура 1,7 Å TRPV6-ARD выявила консервативные структурные элементы, уникальные для ARD белков TRPV. Во-первых, большой поворот между четвертым и пятым повторами индуцируется остатками, консервативными во всех ARD TRPV. Во-вторых, петля третьего пальца является наиболее вариабельной областью по последовательности, длине и конформации. В TRPV6 ряд предполагаемых сайтов регуляторного фосфорилирования картируется в основании этого третьего пальца. TRPV6-ARD не собирается как тетрамер и является мономером в растворе. Измерение напряжения в каналах термо-TRP было рассмотрено Браучи и др.
Каналы TRP имеют шесть спиралей TMS. Эти каналы можно разделить на шесть групп: TRPV (1-6), TRPM (1-8), TRPC (1-7), TRPA1, TRPP (1-3) и TRPML (1-3). Каналы TRP участвуют в мобилизации и реабсорбции внутриклеточного кальция. TRP каннелопатии вовлечены в нейродегенеративные нарушения, сахарный диабет, заболевания кишечника, эпилепсию и рак. Некоторые рецепторы TRP действуют как молекулярные термометры тела. Некоторые из них также играют роль в боли и ноцицепции.
Есть несколько кристаллических структур, доступных для членов семейства TRP-CC. Некоторые из них включают:
VR1: PDB : 2NYJ, 2NYN, 3J5P, 3J5Q, 3J5R
Переходный рецепторный потенциальный катионный канал подсемейства A член 1: PDB : 3J9P
На данный момент в этой статье используется контент из "1.A.4 Семейство каналов Ca2 + Transient Receptor Potential (TRP-CC)", которое лицензировано способом, допускающим повторное использование в соответствии с непортированной лицензией Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0, но не в рамках GFDL. Все соответствующие условия должны быть соблюдены.
