Tet метилцитозиндиоксигеназа 1

редактировать
TET1
Идентификаторы
Псевдонимы TET1, CXXC6, LCX, bA119F7.1, MLL-TET1-MLL, Tet метилцитозиндиоксигеназа 1
Внешние идентификаторыOMIM: 607790 MGI: 1098693 Гомолог Ген: 12735 GeneCards : TET1
Расположение гена (человек)
Хромосома 10 (человека)
Chr. Хромосома 10 (человек)
Хромосома 10 (человека) Местоположение генома для TET1 Местоположение генома для TET1
полоса 10q21.3Начало68,560,337 bp
Конец68,694,487 bp
Orthologs
ВидыЧеловекМышь
Entrez

80312

52463

Ensembl

ENSG00000138336

ENSMUSG00000047146

UniProt

Q8NFU7

Q3URK3

RefSeq (mR2500_0530). NM_027384

RefSeq (белок)

NP_085128

NP_001240786

Местоположение (UCSC)Chr 10: 68,56 - 68,69 МБ Chr 10: 62,8 - 62,91 МБ PubMed поискВикиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Метилцитозиндиоксигеназа 1 с транслокацией десять-одиннадцать (TET1 ) является членом семейства TET из ферментов, у человека он кодируется геном TET1. Его функция, регуляция и используемые пути остаются предметом текущих исследований, хотя, по-видимому, он участвует в деметилировании ДНК и, следовательно, в регуляции гена.

Содержание

  • 1 Discovery
  • 2 Функция
  • 3 Приложения
  • 4 Клиническая значимость
  • 5 Ссылки
  • 6 Дополнительная литература

Discovery

TET1 был впервые обнаружен у 61-летнего пациента с редкой вариацией t (10; 11) (q22; q23) острый миелоидный лейкоз (AML) в качестве связывающего цинкового пальца белка (в частности, в домене CXXC), который сливается с геном MLL. Другое исследование подтвердило, что этот белок был транслокацией партнером MLL у 8-летнего пациента с t (10; 11) (q22; q23) AML и назвало белок Ten- Одиннадцать транслокаций 1.

Функция

TET1 катализирует превращение модифицированного ДНК основания 5-метилцитозина (5- mC) до 5-гидроксиметилцитозина (5-hmC). TET1 производит 5-hmC путем окисления 5-mC в зависимости от железа и альфа-кетоглутарата. Превращение 5-mC в 5-hmC было предложено в качестве начальной стадии активного деметилирования ДНК у млекопитающих. Кроме того, снижение уровня TET1 привело к снижению уровней 5-формилцитозина (5-fC) и 5-карбоксилцитозина (5-caC) как в культурах клеток, так и в мышах.

Сайт с основанием 5-hmC уже имеет повышенную транскрипционную способность. активность, состояние, называемое «функциональное деметилирование». Это состояние характерно для постмитотических нейронов.

Приложения

TET1, по-видимому, способствует ядерному репрограммированию соматических клеток в iPS-клетки.

. Фермент также используется как часть TET-Assisted бисульфитного секвенирования (TAB-seq) для количественной оценки уровней гидроксиметилирования в геноме и для различения 5-гидроксиметилцитозина (5hmc) от 5-метилцитозина (5mc) при разрешении по одному основанию. Этот метод был разработан Чуаном Хе и устраняет неспособность традиционного бисульфитного секвенирования расшифровать между двумя модифицированными основаниями. В этом методе TET1 отвечает за окисление 5mc, что позволяет считать его тимином после обработки бисульфитом. Это не относится к 5hmc, поскольку он глюкозилируется на начальной стадии, ингибируя его окисление с помощью TET1.

Клиническая значимость

Пациенты с шизофренией или биполярным расстройством показали повышенные уровни TET1 мРНК и экспрессию белка в нижняя теменная долька, что указывает на то, что эти заболевания могут быть вызваны ошибками в регуляции экспрессии генов.

Опухоли толстой кишки, груди, простаты и печени имеют значительно более низкие уровни ТЕТ1 по сравнению со здоровыми клетками толстой кишки и нормальные эпителиальные клетки толстой кишки с пониженным уровнем TET1 имеют более высокий уровень пролиферации. Кроме того, повышение уровня экспрессии TET1 в раковых клетках толстой кишки снижает пролиферацию клеток как в культурах клеток, так и у мышей за счет деметилирования промоторов сигнального пути WNT.

линий клеток рака молочной железы. с подавленной экспрессией TET1 увеличиваются скорости инвазии, а рак груди, который распространяется на лимфатические узлы, характеризуется более низкими уровнями TET1. Уровни TET1 можно использовать для обнаружения метастазов рака груди. Ингибитор гистондеацетилазы Трихостатин А повышал уровни TET1 в тканях рака молочной железы, но был менее эффективным супрессором опухоли у пациентов с низкой экспрессией TET1. Пациенты с раком груди с высокими уровнями TET1 имели значительно более высокую вероятность выживания, чем пациенты с низкими уровнями TET1.

Деградация TET1 в вызванных гипоксией клетках EMT рака легких приводила к снижению частоты метастазов и количества клеток. Здоровые клетки, переходящие в раковые клетки, имеют пониженные уровни TET1, но снижение экспрессии TET1 не приводит к злокачественному новообразованию. Раковые клетки, использующие путь KRAS, снизили инвазивный потенциал после повторного введения TET1, аналогичным образом снижение уровня KRAS повысило уровни TET1.

Ссылки

Дополнительная литература

Последняя правка сделана 2021-06-10 02:40:38
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте