Темпл Ф. Смит

Темпл Смит
Темпл Смит в Йельском университете в 2008
Родился	Темпл Феррис Смит. 7 марта 1939 (1939-03-07) (возраст 81). Оберн, Нью-Йорк
Alma mater	Университет Пердью Университет Колорадо в Боулдере (доктор философии)
Известен благодаря	алгоритму Смита-Уотермана
Награды	Премия ISCB Senior Scientist Award (2007) Стипендиат ISCB (2009)
Научная карьера
Учреждения	Бостонский университет
Диссертация	Амплитуды дейтронов из теории ядерного рассеяния составных частиц (1969)
Влияния	Майкл Уотерман
Веб-сайт	www.bu.edu / eng / profile / Temple-f-smith-ph-d /

Темпл Феррис Смит (родился 7 марта 1939 г.) является почетным профессором биомедицинской инженерии, который помог разработать алгоритм Смита-Уотермана вместе с Майклом Уотерманом в 1981 году. Алгоритм Смита-Уотермана служит основой для сравнения нескольких последовательностей, идентифицирующего сегмент с максимальным локальным сходством последовательностей, см. выравнивание последовательностей. Этот алгоритм используется для идентификации похожих сегментов ДНК, РНК и белка. Он был директором Исследовательского центра биомолекулярной инженерии в Бостонском университете в течение двадцати лет, а теперь является профессором заслуженным.

• 1 Образование
• 2 Исследования и карьера
  • 2.1 Выбрано публикации
• 3 Награды и награды
• 4 Ссылки

Смит получил степень бакалавра в 1963 году на физическом факультете Университета Пердью, а в 1969 году - докторскую степень. на физическом факультете Университета Колорадо в Боулдере.

После получения докторской степени Смит провел постдокторское исследование с марта 1969 года по август 1971 года на факультете биофизики. и генетика, Медицинская школа Университета Колорадо, Боулдер.

Его исследования сосредоточены на применении различных компьютерных наук и математических методов для открытия синтаксических и семантических паттернов в последовательностях нуклеиновых кислот и аминокислот. В последние годы это было сосредоточено на молекулярной эволюции семейств белков. такие как бета-пропеллеры WD-повторов, ассоциированная с трансляцией GTPase и рибосомные белки. Он известен созданием алгоритма Смита-Уотермана..

Смит занимал следующие должности:

• 1965–1966: инструктор, ВВС США Лоури, Денвер, Колорадо
• 1971– 1984: профессор кафедры физики Университета Северного Мичигана, Маркетт, Мичиган
• 1985–1991: директор отдела компьютерных исследований молекулярной биологии, Институт рака Дана-Фарбер, Гарвардская медицинская школа и Гарвардская школа общественного здравоохранения
• 1991–2009: директор Ресурсного центра биомолекулярной инженерии, Бостонский университет
• 1999–: соорганизатор, 1999 Институт академического развития молодежи, открывающий День биотехнологии
• 2000– : Соучредитель и директор по информационным технологиям Modular Genetics, Inc.
• 2000–: молодежный тренер по хоккею

Избранные публикации

• М. Мариотти, Смит Т.Ф., Судмант PH и Г. Голдбергер, «Псевдогенизация семенников-специфичного Lfg5 предшествовала расхождению человека / неандертальца», Journal of Human Genetics 59, 288–291 (2014)
• Хайман Хартман и Темпл Ф. Смит «Эволюция рибосомы и генетический код», Life, 4 (2), 227–249 (2014)
• Хартман, Х. и Т.Ф. Смит, «ГТФазы и происхождение рибосомы», Биология Direct, 5: 36-39, (2010)
• Хартман, Хайман и Смит, Темпл Ф. «Эволюция ресничек и эукариотической клетки» Подвижность клеток и цитоскелет. 66: 215-219. (2009)
• Ху, Лан, Смит, Темпл Ф. и Голдбергер, Габриэль. «LFG: кандидат в семейство регуляторных генов апоптоза» Апоптоз. 14: 1255-1265. (2009)
• Смит, Темпл Ф., Ли, Юнг К., Гутелл, Робин Р. и Хартман, Хайман. «Происхождение и эволюция рибосомы» Biology Direct 3: 16, 1–13 (2008)
• Смит, Темпл Ф. «Глава 2: Разнообразие белков-повторов WD» Семейство белков коронина, 20 –30 (2008)
• Бхуткар, Арджун В., Гелбарт, Уильям М. и Смит, Темпл Ф. (2007). Выведение филогении реаранжировки в масштабе генома и порядка предковых генов: тематическое исследование дрозофилы. Genome Biology 8, R236
• Bhutkar, Arjun, Russo, Susan M., Smith, Temple F. и Gelbart, William M. «Анализ генома в масштабе позиционно перемещенных генов» Genome Research 17: 1880-1887 ( 2007)
• Хартман, Хайман, Фаваретто, Паола и Смит, Темпл Ф. «Архейское происхождение эукариотической трансляционной системы» Archaea 2: 1-9 (2006)
• Бьенковска, Ядвига, Хартман, Хайман и Смит, Темпл Ф. (2003). Метод поиска гомологов малых белков, убиквитиноподобных белков в прокариотических клетках? Protein Engineering 16 (12), 897–904.
• Venkatesan, Kavitha, McManus, Heather R., Mello, Craig C., Smith, Temple F. и Hansen, Ulla. (2003). Функциональная консервация между членами древнего семейства дублированных транскрипционных факторов, LSF / Grainyhead. Nucleic Acids Research 31 (15), 4304–4316.
• Zhang YX1, Fox JG, Ho Y, Zhang L, Stills HF Jr, Smith TF. Сравнение гена главного белка наружной мембраны (MOMP) пневмонита мыши (MoPn) и штаммов SFPD хомяка Chlamydia trachomatis с другими штаммами Chlamydia. Mol Biol Evol. 1993 Nov; 10 (6): 1327–42.

Смит был удостоен Премии ISCB Senior Scientist Award и избран членом ISCB в 2009 году. Международным обществом вычислительной биологии.

в 2002 году он был введен в должность в Американский институт медицинской и биологической инженерии (AIMBE) «за выдающийся вклад в определение и развитие области биоинформатики, с упор на новые инженерные методы для прогнозирования структуры и функции белков ».