Целевая масс-спектрометрия

редактировать

Целевая масс-спектрометрия - это метод масс-спектрометрии, в котором используется несколько стадий тандемной масс-спектрометрии (МС с n = 2 или 3) для ионов с определенной массой (m / z ) в определенное время. Значения m / z и времени определены в списке включений, составленном на основе предыдущего анализа.

Содержание

  • 1 Приложения
  • 2 Автоматизация
  • 3 См. Также
  • 4 Ссылки

Приложения

Целевой анализ позволяет проводить тщательный анализ всех ионов во всем указанном выше диапазоне содержания уровень шума в любое временное окно эксперимента. Напротив, нецелевой анализ, как правило, позволяет обнаруживать только 50-100 наиболее распространенных ионов за все время эксперимента. Такое ограничение нецелевого анализа делает его менее подходящим для анализа очень сложных, высокодинамичных образцов, таких как сыворотка крови человека.

Однако методы использования целевой масс-спектрометрии все еще находятся на примитивной стадии в том смысле, что что список включения, используемый в целевом анализе, обычно вручную вводится учеными. Кроме того, для всего эксперимента разрешен только один список включения. Такой ручной процесс трудоемок и подвержен ошибкам. Во многом это связано с отсутствием программного обеспечения для управления масс-спектрометром.

Автоматизация

Были предприняты некоторые усилия по автоматизации создания списков включения с помощью внешнего программного обеспечения. В 2010 году Wu et al. представил полуавтоматический метод определения гликопептида с низким содержанием. Они реализовали автоматизацию с помощью итеративных экспериментов и программного обеспечения с открытым исходным кодом GLYPID. С небольшими изменениями этот подход можно использовать для анализа любых других простых или сложных образцов. В дополнение к преимуществу, упомянутому ранее, этот полуавтоматический подход также экономит значительное количество времени и усилий ученых при ручном подборе ионов и повторной калибровке инструментов.

См. Также

Ссылки

Последняя правка сделана 2021-06-09 10:13:06
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте