TRAF6

TRAF6
Доступные структуры PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1LB4, 1LB5, 1LB6, 2ECI, 2JMD, 3HCS, 3HCT, 3HCU, 4Z8M
Идентификаторы
Псевдонимы	TRAF6, MGC: 3310, RNF85, связанный с рецептором TNF коэффициент 6
Внешние идентификаторы	OMIM: 602355 MGI: 108072 HomoloGene: 3395 Генные карты: TRAF6
Местоположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек) Полоса 11p12 Старт 36 483 769 bp Конец 36 510 272 bp
Расположение гена (мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь) Полоса 2 | 2 E2 Начало 101,678,429 bp Конец 101,701,669 bp
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонной экспрессии
Онтология генов Молекулярная функция •связывание с N-концом белка. •связывание гистондеацетилазы. •GO: 1904264, GO: 1904822, GO : 0090622, GO: 0090302 активность убиквитин протеин-лигазы. •связывание ионов металлов. •митоген-активированная протеинкиназа связывание киназы киназы. •связывание ионов цинка. •GO: 0001948 связывание протеинов. •связывание тиоэстеразы. •убиквитин связывание конъюгированного фермента. •связывание протеинкиназы. •связывание протеинкиназы B. •активность убиквитин-протеинтрансферазы. •идентичное связывание протеина. •связывание убиквитин протеин-лигазы. •активность трансферазы. •связывание с рецептором фактора некроза опухоли. Клеточный компонент •цитоплазма. •цитозоль. •липидная капля. •перинуклеарная область цитоплазмы. •цитоплазматическая сторона плазматической мембраны. •ядро ​​клетки. •мембрана клетки. •кора головного мозга. •мембрана эндосомы. •рецепторный комплекс CD40. •макромолекулярный комплекс. биологический процесс •позитивная регуляция связывания ДНК регуляторной области транскрипции. •ответ на сигнальный путь интерлейкина-1. •толл-подобного рецептора. •Путь передачи сигналов рецептора Fc-эпсилон. •одонтогенез содержащих дентин нг зуб. •положительная регуляция процесса биосинтеза интерлейкина-12. •морфогенез органов животных. •иммунный ответ типа Т-хелперов 1. •сигнальный путь толл-подобного рецептора 9. •регуляция апоптотического процесса. •оссификация. •регуляция секреции иммуноглобулинов. •цитокин-опосредованный сигнальный путь. •дифференцировка остеокластов. •позитивная регуляция дифференцировки остеокластов. •стимулирующий сигнальный путь лектинового рецептора С-типа. •активация NF-каппаB-индуцирующей киназы активность. •резорбция кости. •каскад JNK. •протеолиз внутриклеточного домена мембранного белка. •убиквитинирование белка. •положительная регуляция пролиферации Т-клеток. •I-kappaB киназа / передача сигналов NF-kappaB. •аутоубиквитинирование белка. •процесс иммунной системы. •позитивная регуляция активности киназы JUN. •позитивная регуляция последовательности-специфической активности ДНК-связывающего фактора транскрипции. •полиубиквитинирование белка. •негативная регуляция апоптотического процесса. •негативная реакция регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II. •позитивная регуляция процесса биосинтеза интерлейкина-6. •позитивная регуляция опосредованного липополисахаридом сигнального пути. •активация активности MAPK. •позитивная регуляция активности фактора транскрипции NF-kappaB. •положительная регуляция продукции интерлейкина-2. •положительная регуляция продукции цитокинов Т-клетками. •иммунный ответ. •отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон. •нуклеотид-связывающий домен олигомеризации, содержащий сигнальный путь. •положительный регуляция убиквитинирования белка. •позитивная регуляция пролиферации гладкомышечных клеток. •процессинг антигена и презентация экзогенного пептидного антигена посредством развития клеток MHC класса II. •. •убиквитинирование, связанное с белком K63. •дифференцировка миелоидных дендритных клеток. •MyD88-зависимый сигнальный путь толл-подобных рецепторов. •закрытие нервной трубки. •ремоделирование кости. •позитивная регуляция апоптотического процесса. •pos активная регуляция передачи сигналов I-kappaB киназы / NF-kappaB. •клеточный ответ на липополисахарид. •сигнальный путь рецептора T-клеток. •активация активности протеинкиназы. •позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II. •передача сигнала. •клеточный ответ на стимул повреждения ДНК. •деубиквитинирование белка. •регулирование передачи сигналов I-kappaB / NF-kappaB. •опосредованный интерлейкином-1 сигнальный путь. •клеточный ответ на цитокиновый стимул. •позитивная регуляция передачи сигналов NIK / NF-kappaB. •позитивная регуляция адгезии лейкоцитов к эндотелиальным клеткам сосудов. Источники: Amigo / QuickGO
Orthologs
Species	Человек	Мышь
Entrez	7189	22034
Ensembl	ENSG00000175104	ENSMUSG00000027164
UniProt	Q9Y4K3	P70196
RefSeq (m>NM_145803. NM_004620

NM_009424. NM_001303273

RefSeq (белок)

NP_004611. NP_665802

NP_001290202. NP_033450

Местоположение (UCSC)Chr 11: 36,48 - 36,51 Мб Chr 2: 101,68 - 101,7 Мб PubMed поискВикиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

TRAF6 представляет собой белок человека TRAF.

• 1 Функция
• 2 Взаимодействия
• 3 Модельные организмы
• 4 Ссылки
• 5 Дополнительная литература
• 6 Внешние ссылки

Закодированный белок этим геном является членом семейства белков фактора, ассоциированного с рецептором TNF (TRAF). Белки TRAF связаны с членами суперсемейства рецепторов TNF и опосредуют их передачу. Этот белок опосредует передачу сигналов не только от членов суперсемейства рецепторов TNF, но также от членов семейства Toll / IL-1. Было показано, что сигналы от рецепторов, таких как CD40, TNFSF11 / TRANCE / RANKL и IL-1, опосредуются этим белком. Этот белок также взаимодействует с различными протеинкиназами, включая IRAK1 / IRAK, SRC и PKCzeta, что обеспечивает связь между различными сигнальными путями. Этот белок функционирует как преобразователь сигнала в пути NF-kappaB, который активирует киназу IkappaB (IKK) в ответ на провоспалительные цитокины. Было обнаружено, что взаимодействие этого белка с UBE2N / UBC13 и UBE2V1 / UEV1A, которые представляют собой конъюгированные с убиквитином ферменты, катализирующие образование полиубиквитиновых цепей, необходимо для активации IKK этим белком. Сообщалось о двух альтернативно сплайсированных вариантах транскриптов, кодирующих идентичные белки.

Путь передачи сигналов toll-подобных рецепторов. Пунктирные серые линии представляют неизвестные ассоциации

TRAF6, как было показано, взаимодействует с:

• ASK1,
• CD40,
• FHL2,
• HSPB2,
• IKBKG,
• IRAK1,
• IRAK2,
• MAP3K7IP1,
• MAP3K7IP2,
• MAP3K7
• PPP4C,
• RANK,
• SDCBP,
• SIGIRR,
• Sequestosome 1,
• T4601BPFA1,
• T4601BPFA1 449>TNFRSF13B,
• UBE2N и
• убиквитин C.

Модельные организмы были использованы в исследовании функции TRAF6. Условная линия нокаутирующей мыши под названием Traf6 была сгенерирована в Wellcome Trust Sanger Institute. Самцы и самки животных подвергались стандартизированному фенотипическому скринингу для определения эффектов делеции. Проведены дополнительные скрининги: - Углубленное иммунологическое фенотипирование

Нокаутный фенотип мыши по Traf6

Характеристика	Фенотип
Все данные доступны на.
Лейкоциты периферической крови 6 недель	Нормальный
Инсулин	Нормальный
Гематология 6 недель	Нормальный
Гомозиготная жизнеспособность при P14	Аномальная
Рецессивная летальная исследование	Аномальное
Масса тела	Нормальное
Неврологическое обследование	Нормальное
Сила захвата	Нормальное
Дисморфология	Нормально
Непрямая калориметрия	Нормально
Тест толерантности к глюкозе	Нормально
Слуховой ответ ствола мозга	Нормально
DEXA	Нормально
Рентгенография	Нормально
Морфология глаза	Нормальный
Клинический химический состав	Нормальный
Гематология 16 недель	Нормальный
Лейкоциты периферической крови 16 недель	Нормальный
Масса сердца	Нормально
Сальмонелла инфекция	Нормальная
Цитотоксическая функция Т-лимфоцитов	Нормальная
Иммунофосфат селезенки энотипирование	Нормальное
Иммунофенотипирование мезентериального лимфатического узла	Нормальное
Состав эпидермального иммунитета	Нормальный

• TRAF6 в Национальной медицинской библиотеке США Медицинские предметные рубрики (MeSH)