Рибопереключатель TPP (элемент THI) | |
---|---|
Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности TPP | |
Идентификаторы | |
Символ | TPP |
Alt. Символы | THI |
Rfam | RF00059 |
Прочие данные | |
РНК тип | Цис-рег ; рибопереключатель |
Домен (ы) | Эукариота ; Бактерии ; Археи |
GO | 0030976 |
SO | 0000035 |
PDB структуры | PDBe 4nyc |
Рибопереключатель TPP, также известный как элемент THI и Рибопереключатель ти-бокса представляет собой высококонсервативную РНК вторичную структуру. Он служит рибопереключателем, который напрямую связывает тиаминпирофосфат (TPP) и модулирует экспрессию гена с помощью различных механизмов в архей, бактерии и эукариоты. TPP представляет собой активную форму тиамина (витамин B1), незаменимого кофермента, синтезируемого путем сочетания пиримидиновой и тиазольной частей в бактериях. Элемент THI является продолжением ранее обнаруженного тиамин-регуляторного элемента, thi box, существует значительная вариабельность в прогнозируемой длине и структурах дополнительных и факультативных петель ствола, представленных темно-синим цветом на диаграмме вторичной структуры. Анализ структуры оперона идентифицировали большое количество новых кандидатов регулируемых тиамином генов, в основном транспортеров, в различных прокариотических организмах. Решена рентгеновская кристаллическая структура аптамера рибопереключателя TPP.