TIGRFAMs

редактировать

TIGRFAMs - это база данных семейств белков, предназначенная для поддержки ручного и автоматического аннотации генома. Каждая запись включает множественное выравнивание последовательностей и скрытую марковскую модель (HMM), построенную на основе выравнивания. Последовательности, которые набирают баллы выше определенных пороговых значений данного HMM TIGRFAM, назначаются этому семейству белков и могут иметь соответствующие аннотации.

Как и Pfam, TIGRFAMs использует пакет HMMER, написанный Шоном Эдди. ТИГРФАМ производится на заводе J. Институт Крейга Вентера. Это одна из 11 баз данных в InterPro. Текущая версия TIGRFAM, выпуск 15.0, насчитывает 4488 моделей.

Ссылки

Внешние ссылки

.

Последняя правка сделана 2021-06-09 05:56:29
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте