Войти
TIGRFAMs - это база данных семейств белков, предназначенная для поддержки ручного и автоматического аннотации генома. Каждая запись включает множественное выравнивание последовательностей и скрытую марковскую модель (HMM), построенную на основе выравнивания. Последовательности, которые набирают баллы выше определенных пороговых значений данного HMM TIGRFAM, назначаются этому семейству белков и могут иметь соответствующие аннотации.
Как и Pfam, TIGRFAMs использует пакет HMMER, написанный Шоном Эдди. ТИГРФАМ производится на заводе J. Институт Крейга Вентера. Это одна из 11 баз данных в InterPro. Текущая версия TIGRFAM, выпуск 15.0, насчитывает 4488 моделей.
.
