Войти
| Сортировка по семейству | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Пилус-родственная сортаза C стрептококка группы B. Запись PDB 3O0P | |||||||||
| Identifiers | |||||||||
| Symbol | Sortase | ||||||||
| Pfam | PF04203 | ||||||||
| InterPro | IPR005754 | ||||||||
| SCOPe | 1ija / SUPFAM | ||||||||
| суперсемейство OPM | 294 | ||||||||
| белок OPM | 1rz2 | ||||||||
| CDD | cd00004 | ||||||||
| |||||||||
Сортаза относится к группе прокариотических ферментов, которые модифицируют поверхностные белки путем распознавания и расщепления карбоксильных групп. клемма сигнал сортировки. Для большинства субстратов ферментов сортировки сигнал распознавания состоит из мотива LPXTG (Leu-Pro-any-Thr-Gly), затем высокогидрофобной трансмембранной последовательности, за которой следует кластер основных остатков, таких как аргинин. Между Thr и Gly происходит расщепление с временным присоединением через остаток Thr к остатку Cys в активном центре с последующей транспептидацией, которая ковалентно прикрепляет белок к компонентам клеточной стенки. Сортазы встречаются почти у всех грамположительных бактерий и случайных грамотрицательных бактерий (например, Shewanella putrefaciens ) или архей (например, Methanobacterium thermoautotrophicum ), где LPXTG-опосредованное украшение клеточной стенки не зарегистрировано. Хотя сортаза A, «домашняя» сортировка, обычно действует на многие белковые мишени, другие формы сортировки распознают вариантные формы мотива расщепления или катализируют сборку пилинов в пили.
Сортаза Staphylococcus aureus представляет собой транспептидазу, которая прикрепляет поверхностные белки к клеточной стенке; он расщепляет Gly и Thr мотива LPXTG и катализирует образование амидной связи между карбоксильной группой треонина и аминогруппой пептидогликана клеточной стенки.
Белки-субстраты, прикрепленные к клеточным стенкам с помощью сортаз, включают ферменты, пилины и опосредующие адгезию гликопротеины с большой поверхностью. Эти белки часто играют важную роль в вирулентности, инфекции и колонизации патогенами.
Поверхностные белки не только способствуют взаимодействию между вторгающимся патогеном и тканями животных, но также обеспечивают оригинальные стратегии ухода бактерий от иммунного ответа хозяина. В случае с С. aureus, протеин А, иммуноглобулины захватываются на микробной поверхности и маскируют бактерии во время вторжения в ткани хозяина. Мутанты S. aureus, лишенные гена srtA, не могут заякорять и отображать некоторые поверхностные белки, и у них нарушена способность вызывать инфекции у животных. Сортаза действует на поверхностные белки, которые запускаются в путь секреции (Sec), и их сигнальный пептид удаляется сигнальной пептидазой. Геном S. aureus кодирует два набора генов сортировки и секреции. Вполне возможно, что S. aureus развил более одного пути для транспорта 20 поверхностных белков к оболочке клеточной стенки.
Обратите внимание, что экзосортаза и археосортаза функционально аналогичны, но никоим образом не гомологичны сортазе.
Считается, что сортазы являются хорошими мишенями для новых антибиотиков, поскольку они являются важными белками для патогенных бактерий, и по крайней мере одна компания отметила некоторый ограниченный коммерческий интерес.
Эта группа цистеинпептидаз принадлежат к семейству пептидаз MEROPS C60 (клан C-) и включают членов нескольких подсемейств сортаз.
Другое подсемейство сортаз (C60B в MEROPS) содержит белки бактериальной сортировки B длиной примерно 200 остатков.
Транспептидазная активность сортазы используется структурными биологами для производства гибридных белков in vitro. Мотив узнавания (LPXTG) добавляется к С-концу представляющего интерес белка, тогда как мотив олигоглицина добавляется к N-концу второго белка, подлежащего лигированию. При добавлении сортазы к смеси белков два пептида ковалентно связаны посредством нативной пептидной связи. Эта реакция используется специалистами по ЯМР-спектроскопии для получения невидимых меток растворимости ЯМР и, в одном примере, рентгеновскими кристаллографами для ускорения образования комплексов.
