Войти
Расширение с одной базой (SBE) - это метод определения идентичности нуклеотид основание на конкретном p позиционирование вдоль нуклеиновой кислоты. Метод используется для идентификации однонуклеотидного полиморфизма (SNP).
В этом способе праймер олигонуклеотида гибридизуется с комплементарной областью вдоль нуклеиновой кислоты с образованием дуплекса, причем концевой 3'-конец праймера непосредственно примыкает к определяемому нуклеотидному основанию.. С помощью ДНК-полимеразы олигонуклеотидный праймер ферментативно удлиняется одним основанием в присутствии всех четырех терминаторов нуклеотидов; терминатор нуклеотида, комплементарный основанию в исследуемой матрице, включается и идентифицируется. Присутствие всех четырех терминаторов подавляет неправильное включение некомплементарных нуклеотидов. Для определения идентичности включенного терминатора можно использовать множество подходов, включая флуоресцентное мечение, масс-мечение для масс-спектрометрии, мечение изотопов, мечение основания гаптеном и хромогенное обнаружение с помощью конъюгата антитело против гаптена-фермент (например, с помощью формат ELISA).
Метод был изобретен Филипом Голетом, Майклом Кнаппом, Ричардом Дугласом и Стивеном Андерсоном во время работы в компании Molecular Tool. Этот подход был разработан для высокопроизводительного генотипирования SNP и первоначально назывался «Генетический битовый анализ» (GBA). Illumina, Inc. использует этот метод в своей технологии Infinium (http://www.illumina.com/technology/beadarray-technology/infinium-hd-assay.html ) для измерения метилирования ДНК уровней в геноме человека.
