Полимер с контролируемой последовательностью

редактировать
Рис. 1. Синтетическое обоснование полимеров с контролируемой последовательностью. Показанные здесь A и B представляют собой два само реагирующих мономера, один из которых предварительно защищен и после этого может быть снята защита, чтобы вызвать следующее добавление. На основе селективной реакции AB, мономеры могут быть добавлены к полимерной цепи упорядоченным образом.

A полимер с контролируемой последовательностью представляет собой макромолекулу, в которой последовательность мономеров до некоторой степени контролируется. Этот контроль может быть абсолютным, но не обязательно. Другими словами, полимер с контролируемой последовательностью может быть однородным (его дисперсность Ð равна 1) или неоднородным (Ð>1). Например, чередующийся сополимер, синтезированный с помощью радикальной полимеризации, представляет собой полимер с контролируемой последовательностью, даже если он также является неоднородным полимером, в котором цепи имеют разную длину цепи и немного разные композиции. биополимер (например, белок ) с четко определенной первичной структурой также является полимером с контролируемой последовательностью. Однако в случае однородных макромолекул также можно использовать термин полимер с определенной последовательностью.

По сравнению с традиционными полимерами, состав полимеров с контролируемой последовательностью может быть точно определен с помощью методов химического синтеза, таких как многокомпонентные реакции, реакции щелчка и т. Д. Такой настраиваемый способ полимеризации наделяет полимеры с контролируемой последовательностью с особыми свойствами и, таким образом, разрабатываются приложения на основе полимеров с регулируемой последовательностью (например, хранение информации, биоматериалы, наноматериалы и т. Д.).

В природе ДНК, РНК, белки и другие макромолекулы также могут распознаваться как полимеры с контролируемой последовательностью из-за их хорошо упорядоченных структурных скелетов. ДНК, основанная на парах оснований A-T, C-G, формируется в хорошо выровненных последовательностях. Благодаря точным последовательностям ДНК 20 аминокислот способны генерировать последовательные пептидные цепи с трехмерной структурой благодаря процессу транскрипции и трансляции. Эти упорядоченные последовательности различных компонентов наделяют организмы сложными и разнообразными функциями.

Содержание

  • 1 Синтетические методы
    • 1.1 Последовательная биологическая полимеризация
    • 1.2 Последовательная химическая полимеризация
      • 1.2.1 Твердофазный синтез
      • 1.2.2 Последовательно-контролируемая радикальная полимеризация
      • 1.2.3 Нерадикальная полимеризация с контролируемой последовательностью
  • 2 Методология улучшения контроля последовательности
    • 2.1 Использование шаблонов
    • 2.2 Регулирование реакционной способности мономера
    • 2.3 Встраивание, ориентированное на распознавание
  • 3 Свойства и приложения
  • 4 Ссылки

Синтетические методы

Традиционные полимеры обычно состоят из одного повторяющегося звена или нескольких повторяющихся звеньев, расположенных в случайной последовательности. Полимеры с контролируемой последовательностью состоят из различных повторяющихся звеньев, которые расположены упорядоченным образом. Для контроля последовательности разрабатываются различные синтетические методики.

Биологическая полимеризация, контролируемая последовательностью

Рис. 2. Схематическая диаграмма процесса транскрипции-трансляции в рибосоме. Кодон в мРНК и его специфическое распознавание с помощью тРНК обеспечивают упорядоченную последовательность пептида. Пептидные связи образуются посредством амидирования между аминогруппой и сложноэфирной группой в двух соседних тРНК, наряду с поэтапным удалением передней тРНК и вставкой последующей тРНК. Этот редупликативный цикл дает полимер с контролируемой последовательностью (пептиды).

ДНК, РНК и белки являются наиболее распространенными полимерами с контролируемой последовательностью у живых существ. Вдохновленные ими, были разработаны методы полимеризации с использованием ДНК или РНК в качестве матриц для контроля последовательностей полимера. Сначала, взяв ДНК или РНК в качестве матриц, ученые разработали серию полимеров на основе пептидных нуклеиновых кислот (ПНК) без использования ДНК полимераз. Но этот метод ограничен масштабом полимеризации и выходом. После этого разрабатывается полимеразная цепная реакция (ПЦР), которая в настоящее время все еще является наиболее широко используемым методом с регулируемой последовательностью. При использовании ферментов выходы и масштабы значительно увеличиваются, но специфичность ферментов по отношению к природным пептидам в определенной степени ограничивает этот метод. В настоящее время все больше внимания уделяется использованию рибосом для прямой имитации процесса транскрипции и трансляции. Эта технология, называемая инженерия белков, считается наиболее перспективным методом биологической полимеризации для синтеза полимеров с контролируемой последовательностью.

Химическая полимеризация с контролируемой последовательностью

Помимо методов биологической полимеризации, ученые также разработали множество методов химического синтеза для полимеров с контролируемой последовательностью. По сравнению с биологической полимеризацией химическая полимеризация может обеспечить большее разнообразие, но большинство химических методов не могут обеспечить эффективность и специфичность биологических методов.

Твердофазный синтез

Одним из методов химической полимеризации является твердофазный синтез, который может быть использован для синтеза пептидов, состоящих из природных и неприродных аминокислот. В этом методе мономеры присоединяются к полимерной цепи посредством амидирования между карбонильной группой и аминогруппой. В целях контроля последовательности аминогруппы обычно защищены 9-флуоренилметилоксикарбонильной группой (Fmoc ) и трет-бутилоксикарбонилом (Boc), которые могут быть удалены в основной и кислотной среде соответственно для участия в следующем цикле. удлинение цепи.

Радикальная полимеризация с контролируемой последовательностью

Радикальная полимеризация является одним из наиболее часто используемых методов полимеризации. Около 50% имеющихся в продаже полимеров синтезируется радикальной полимеризацией. Однако недостатки этого метода очевидны: последовательности и полимерные элементы нельзя хорошо модулировать. Чтобы преодолеть эти ограничения, ученые оптимизировали используемые протоколы. Первым описанным примером было контролируемое по времени последовательное добавление высокореакционноспособных N-замещенных малеимидов в радикальной полимеризации с переносом атома стирола, что привело к программированию последовательности функциональных мономеров. Также сообщалось о развитии присоединения одной молекулы в радикальной полимеризации с переносом атома (ATRP), которая усиливает контроль последовательности радикальной полимеризации. Другие решения включают использование промежуточных стадий очистки для выделения желаемой олигомерной последовательности между последующей полимеризацией с переносом цепи с обратимым присоединением-фрагментацией (RAFT-полимеризациями). И флэш-хроматография на колонке, и эксклюзионная хроматография с рециклингом оказались успешными в этом отношении. Встраивание единичного мономера RAFT (SUMI) недавно было разработано как новая технология для точного контроля последовательности мономера.

Нерадикальная полимеризация, управляемая последовательностью

Рис. 3. Пример щелочной химии в синтезе последовательности - контролируемые полимеры. (R относится к различным типам функциональных групп)

В связи с существенной нехваткой радикальной полимеризации для полимеров с контролируемой последовательностью также разрабатываются другие нерадикальные полимеризации. В рамках этих нерадикальных методов азид-алкиновое циклоприсоединение (также известное как реакция щелчка), метатезис олефинов среди других используются для конструирования полимеров с контролируемой последовательностью. В зависимости от этих конкретных химических реакций, мономеры точно добавляются к полимерной цепи, и хорошо упорядоченная цепь образуется поэтапно. Между тем, применяя несколько химических реакций, химики также разработали многокомпонентные реакции, чтобы ускорить построение полимерных каркасов, а также увеличить разнообразие. Помимо вышеупомянутого, была исследовательская группа, разрабатывающая молекулярную машину, которая успешно достигла полимеризации с контролируемой последовательностью олигопептидов.

Методология улучшения контроля последовательности

Наиболее важный характер полимеров с контролируемой последовательностью это управляемая последовательность полимерного каркаса. Тем не менее, реализация точного контроля последовательности и регуляции последовательностей в больших полимерных основных цепях также является наиболее актуальной проблемой, которую необходимо решать в области полимеров с контролируемой последовательностью. Были предприняты большие усилия в разработке и оптимизации методов для улучшения свойств контроля последовательности существующих в настоящее время синтетических методов, а также для дальнейшего развития совершенно новых методов с лучшей синтетической эффективностью и контролем последовательности.

Использование шаблонов

Одним из наиболее важных отличий биосинтеза с контролем последовательности по сравнению с другими методами химического синтеза является то, что биомолекулы (включая ДНК и РНК) могут инициировать свою полимеризацию с использованием высоко запрограммированных шаблонов. Следовательно, методы биосинтеза, такие как ПЦР, по-прежнему считаются одним из наиболее убедительных способов разработки полимеров с контролируемой последовательностью.

Регулирование реакционной способности мономера

Модулирование реакционной способности между мономером и растущей полимерной цепью является другим подходом к усилению контроля последовательности. Обоснование этого метода состоит в том, что мономер должен быть активирован первым катализатором вначале в виде неактивных частиц, которые затем могут участвовать в полимеризации при введении второго катализатора. Реальным примером является использование HI в качестве первого катализатора и ZnI 2 в качестве второго катализатора для достижения полимеризации с контролируемой последовательностью простых виниловых эфиров и стирола. производные.

Встраивание, ориентированное на распознавание

Рис. 4. Пример использования цепи амина в качестве сайта распознавания для прямого сайт-специфического добавления мономера

В этом подходе предлагается сайт узнавания в полимере для нековалентного закрепления мономера на полимерной цепи, которая впоследствии может пройти через химическую вставку в основную цепь полимера. Один успешный пример демонстрирует, что метакриловая кислота (мономер) может быть радикально включена в основную цепь с узнаваемым катионным сайтом (протонат d первичный амин цепочка). Управляемая этой сайт-специфической реакцией, полимеризация с контролируемой последовательностью может быть достигнута с помощью шаблона, украшенного различными узнаваемыми кулонами.

Свойства и применение

Наиболее отличительной особенностью полимеров с контролируемой последовательностью является хорошо упорядоченные цепи, состоящие из различных повторяющихся звеньев. За счет кодирования повторяющихся единиц соответственно синтезированный полимер с контролируемой последовательностью может использоваться для хранения данных. Чтобы модифицировать мономер некоторыми биоактивными фрагментами, полученный полимер с контролируемой последовательностью может лечить заболевания. Свойство управления последовательностью делает полимеры с контролируемой последовательностью идеальной платформой для установки различных видов подвесок (таких как лекарства, катализатор ), посредством чего могут быть реализованы различные функции и приложения.

Ссылки

Последняя правка сделана 2021-06-07 10:45:21
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте