Войти
Архивирование данных исследований является длительное хранение академических научно - исследовательских данных, в том числе естественных наук, социальных наук и наук о жизни. Различные академические журналы имеют разную политику в отношении того, сколько своих данных и методов исследователи должны хранить в общедоступном архиве, а то, что фактически заархивировано, сильно различается в зависимости от дисциплины. Точно так же основные организации, предоставляющие гранты, по-разному относятся к публичному архивированию данных. В целом, научная традиция заключалась в том, чтобы публикации содержали достаточно информации, чтобы позволить коллегам-исследователям воспроизвести и, следовательно, проверить результаты исследования. В последние годы этот подход становится все более натянутым, поскольку исследования в некоторых областях зависят от больших наборов данных, которые нелегко воспроизвести независимо.
В одних областях архивирование данных важнее, чем в других. В некоторых полях все данные, необходимые для репликации работы, уже доступны в статье журнала. При разработке лекарств создается большой объем данных, которые необходимо архивировать, чтобы исследователи могли убедиться, что отчеты, публикуемые фармацевтическими компаниями, точно отражают эти данные.
Требование архивирования данных - недавнее событие в истории науки. Это стало возможным благодаря достижениям в области информационных технологий, позволяющих хранить большие объемы данных и получать к ним доступ из центральных мест. Например, Американский геофизический союз (AGU) принял свою первую политику в отношении архивирования данных в 1993 году, примерно через три года после начала WWW. Эта политика требует, чтобы наборы данных, цитируемые в документах AGU, архивировались в признанном центре обработки данных; это позволяет создавать «информационные бюллетени»; и устанавливает роль AGU в поддержании архивов данных. Но он не требует от авторов статей архивировать свои данные.
Перед организованным архивированием данных исследователи, желающие оценить или воспроизвести статью, должны будут запросить данные и информацию о методах у автора. Академическое сообщество ожидает, что авторы поделятся дополнительными данными. Этот процесс был признан расточительным по времени и энергии и дал неоднозначные результаты. Информация может быть утеряна или повреждена с годами. В некоторых случаях авторы просто отказываются предоставить информацию.
Потребность в архивировании данных и должной осмотрительности значительно возрастает, когда исследования касаются вопросов здравоохранения или формирования государственной политики.
Biotropica требует в качестве условия публикации, чтобы данные, подтверждающие результаты в документе, и метаданные, описывающие их, были заархивированы в соответствующем общедоступном архиве, таком как Dryad, Figshare, GenBank, TreeBASE или NCBI. Авторы могут решить сделать данные общедоступными, как только статья будет опубликована, или, если технология архива позволяет, запретить доступ к данным в течение трех лет после публикации статьи. Заявление с описанием доступности данных будет включено в рукопись, как описано в инструкциях для авторов. Исключения из обязательного архивирования данных могут быть предоставлены по усмотрению главного редактора для исследований, которые включают конфиденциальную информацию (например, местонахождение исчезающих видов). Нашу редакцию, объясняющую мотивацию этой политики, можно найти здесь. Более полный список репозиториев данных доступен здесь. Поощрение культуры сотрудничества с исследователями, которые собирают и архивируют данные: данные, собираемые тропическими биологами, часто являются долгосрочными, сложными и дорогостоящими для сбора. Совет редакторов Biotropica настоятельно рекомендует авторам, которые повторно используют архивы данных заархивированные наборы данных, включать в качестве полностью вовлеченных сотрудников ученых, которые первоначально их собрали. Мы считаем, что это значительно повысит качество и влияние результирующего исследования, опираясь на глубокое понимание сборщика данных естественной истории системы исследования, уменьшая риск ошибок в новом анализе и стимулируя междисциплинарный и кросс-культурный подход. сотрудничество и обучение, за которые широко признаны ATBC и Biotropica.
NB: Biotropica - один из двух журналов, которые платят гонорары авторам, размещающим данные в Dryad.
Американский натуралист требует, чтобы авторы помещали данные, связанные с принятыми статьями, в публичный архив. Для данных о последовательности генов и филогенетических деревьев требуется хранение в GenBank или TreeBASE, соответственно. Существует множество возможных архивов, которые могут соответствовать определенному набору данных, включая репозиторий Dryad для данных экологической и эволюционной биологии. Все регистрационные номера для GenBank, TreeBASE и Dryad должны быть включены в принятые рукописи, прежде чем они попадут в производство. Если данные хранятся где-то еще, укажите ссылку. Если данные взяты из опубликованной литературы, пожалуйста, поместите сопоставленные данные в Dryad для удобства ваших читателей. Любые препятствия для обмена данными должны быть доведены до сведения редакции во время представления, чтобы можно было разработать соответствующие меры.
Первичные данные, лежащие в основе выводов статьи, имеют решающее значение для проверяемости и прозрачности научного предприятия и должны быть сохранены в пригодной для использования форме в течение десятилетий в будущем. По этой причине Journal of Heredity требует, чтобы вновь сообщенные нуклеотидные или аминокислотные последовательности и структурные координаты были отправлены в соответствующие общедоступные базы данных (например, GenBank; База данных нуклеотидных последовательностей EMBL ; База данных ДНК Японии; Банк данных по белкам ; и Swiss -Прот ). Регистрационный номер должен быть включен в окончательную версию рукописи. Для других форм данных (например, микросателлитные генотипы, карты связей, изображения) Журнал поддерживает принципы Совместной политики архивирования данных (JDAP), побуждающие всех авторов архивировать первичные наборы данных в соответствующем общедоступном архиве, таком как Dryad, TreeBASE. или Сеть знаний по биокомплексности. Авторам рекомендуется сделать данные общедоступными во время публикации или, если технология архива позволяет, отказаться от доступа к данным на период до года после публикации. Американская генетическая ассоциация также признает огромные инвестиции отдельных исследователей в создание и обработку больших наборов данных. Следовательно, мы рекомендуем уважать это вложение во вторичный анализ или метаанализ в духе доброжелательного сотрудничества.
- oxfordjournals.orgКомпания Molecular Ecology ожидает, что данные, подтверждающие результаты в статье, должны быть заархивированы в соответствующем общедоступном архиве, таком как GenBank, Gene Expression Omnibus, TreeBASE, Dryad, Knowledge Network for Biocomplexity, в вашем собственном институциональном репозитории или репозитории спонсора или в качестве вспомогательной информации на веб-сайт «Молекулярная экология». Данные являются важным продуктом научного предприятия, и их следует сохранять и использовать в течение десятилетий в будущем. Авторы могут выбрать, чтобы данные были общедоступными во время публикации, или, если технология архива позволяет, могут запретить доступ к данным на период до года после публикации. По усмотрению редактора могут быть предоставлены исключения, особенно для конфиденциальной информации, такой как данные о человеке или местонахождение исчезающих видов.
- ВайлиТакие материалы должны быть размещены на аккредитованном независимом сайте (URL-адрес и номера доступа должны быть предоставлены автором) или отправлены в журнал Nature при отправке, либо загружены через онлайн-службу подачи журнала, либо, если файлы слишком большие или в неподходящий для этого формат, на CD / DVD (пять копий). Такие материалы не могут размещаться исключительно на личном или институциональном веб-сайте автора. Природа требует, чтобы рецензент определил, все ли дополнительные данные и методы были заархивированы. Политика рекомендует рецензентам рассмотреть несколько вопросов, в том числе: «Следует ли просить авторов предоставить дополнительные методы или данные для сопровождения статьи в Интернете? (Такие данные могут включать исходный код для моделирования исследований, подробные экспериментальные протоколы или математические выводы).
- ПриродаНаука поддерживает усилия по созданию баз данных, которые собирают опубликованные данные для использования научным сообществом. Поэтому перед публикацией большие наборы данных (включая данные микрочипов, последовательности белков или ДНК, координаты атомов или карты электронной микроскопии для макромолекулярных структур) должны быть депонированы в утвержденной базе данных, а номер доступа должен быть предоставлен для включения в опубликованный документ. «Материалы и методы» - Наука теперь требует, чтобы авторы, как правило, размещали большую часть своих описаний материалов и методов в Интернете в качестве вспомогательного материала, предоставляя в печатной рукописи столько описания методов, сколько необходимо для следования логике текста.. (Очевидно, это ограничение не будет применяться, если статья в основном представляет собой исследование нового метода или техники.)
- НаукаЧтобы позволить другим проверять и развивать работу, опубликованную в журналах Королевского общества, это условие публикации, когда авторы предоставляют данные, код и исследовательские материалы, подтверждающие результаты в статье.
Наборы данных и код должны храниться в соответствующем, признанном, общедоступном репозитории. Если репозиторий для конкретных данных не существует, авторы должны размещать свои наборы данных в общем репозитории, таком как Dryad (репозиторий) или Figshare.
- Королевское обществоЖурнал археологической науки имел политику раскрытия данных, по крайней мере, 2013. Их политика государство, что «все данные, относящиеся к статье должны быть предоставлены в дополнительных файлах или депонированные во внешних хранилищах и связанные с в статье. Политика рекомендует размещать данные в хранилище, таком как Служба археологических данных, Цифровая археологическая запись или PANGEA. Исследование 2018 года показало, что уровень доступности данных составляет 53%, что свидетельствует либо о слабом соблюдении этой политики, либо о неполном понимании редакторами, рецензентами и авторами того, как интерпретировать и применять эту политику.
В США Национальный научный фонд (NSF) ужесточил требования к архивированию данных. Исследователи, ищущие финансирование от NSF, теперь должны подать план управления данными в виде двухстраничного приложения к заявке на грант.
Инициатива NSF Datanet привела к финансированию проекта Data Observation Network for Earth ( DataONE ), который обеспечит архивирование научных данных для экологических и экологических данных, созданных учеными всего мира. Заявленная цель DataONE - сохранить и предоставить доступ к разномасштабным, многопрофильным и многонациональным данным. В сообщество пользователей DataONE входят ученые, менеджеры экосистем, политики, студенты, преподаватели и общественность.
Немецкий DFG требует, чтобы данные исследований хранились в собственном учреждении исследователя или в соответствующей общенациональной инфраструктуре в течение как минимум 10 лет.
Британский центр цифрового курирования ведет обзор политик спонсора в отношении данных.
Данные исследований хранятся в библиотеках данных или архивах данных.
