Шлезвиг-Гольштейн-Зондербург было названием ветки Дома Ольденбургов, а также названием их земли. Оно просуществовало с 1564 по 1668 год и было титульным герцогством при короле Дании, а не истинным территориальным герцогством само по себе. Местопребыванием герцога было Сённерборг. Части владений были расположены в Дании (в герцогстве Шлезвиг ), в основном на островах Альс и Эрё и около Глюксбург, в то время как другие земли были частью Священной Римской империи (в герцогстве Голштинском ), в том числе Ämter из Plön, Ahrensbök и Райнфельд. В результате различных форм наследования он раздробился на множество небольших территорий, которые в конце концов были присоединены к Великой Дании в 18 веке.
Герцогская семья была связана с Домом Шлезвиг-Гольштейн-Готторп ; оба принадлежали к дому Ольденбургских. Герцогство было создано в 16 веке, когда король Дании Фридрих II разделил свою часть герцогств Шлезвиг и Гольштейн со своими двумя братьями, каждый из которых получил треть королевского поместья в Шлезвиг и Гольштейн. Зондербург был участком, полученным герцогом Иоанном III, по прозвищу «Младший». Его владения включали, среди прочего, территории Зондербург, Норбург, Эрё, Плён и Аренсбёк вместе с их назначенные Ämter или административные офисы. Однако разделение не было признано местными дворянами, которые считали его незаконным, и новым герцогством управлял герцог Иоанн как так называемый abgeteilter Herr, то есть правитель, не имевший согласия его местные домовладельцы. Итак, хотя герцог Зондербург получил герцогский титул и доход с закрепленной за ним территории, он не имел политических прав на этой территории. Суверенитет остался за королем Дании в его роли герцога Шлезвиг-Гольштейн.
Герцоги Шлезвиг-Гольштейн-Зондербург неоднократно разделяли свои владения между своими наследников, так что возникло множество очень маленьких территорий.
После смерти герцога Иоанна в 1622 году герцогство было разделено между сыновьями, которые были законными наследниками, и дом Шлезвиг-Гольштейн-Зондербург произвел несколько дополнительных линий. Названия отдельных линий добавляли название их соответствующего города Residenz к семейной линии. Сыновья герцога Александра - сына герцога Иоанна - также получили или приобрели некоторые территории за пределами Шлезвиг-Гольштейна, чтобы поддерживать себя.
У некоторых из вновь созданных княжеств было всего несколько квадратных километров земли, а их хозяевами были просто титульные герцоги. Эти новые линии иногда длились недолго, прежде чем их владения переходили в другие линии в результате наследования или банкротства или даже возвращались датскому королевскому дому.
В 1668 году король Дании конфисковал Зондербург из-за чрезмерного долга. Однако некоторые из линий, которые отделились от Зондербурга, продолжали существовать. На деньги, которые остались после выплаты всех долгов, последний герцог Зондербургский купил недвижимость во Францхагене около Шулендорфа ; отныне род был известен как Францхаген .
Герцоги Шлезвиг-Гольштейн-Зондербург образуют линию Дома Ольденбургских ; он состоит из потомков по мужской линии герцога Иоанна Младшего. Нынешние королевские дома Дании и Норвегии принадлежат к линии Шлезвиг-Гольштейн-Зондербург.