Две из этих тюрем расположены в Зале правосудия на Брайант-стрит. Одна из тюрем находится в палате 7D / 7L в больнице общего профиля Сан-Франциско. Две тюрьмы расположены в комплексе программ Сан-Бруно, расположенном в десяти милях к югу от Сан-Франциско.
Новейший тюремный комплекс Сан-Франциско расположен недалеко от Зала правосудия на Седьмой улице. Открытый в 1994 году комплекс представляет собой две тюрьмы. Эта главная сложная тюрьма представляет собой «учреждение прямого надзора, [которое] стало национальной моделью программной реабилитации заключенных». Второй, который действует как главный приемный и выпускной объект для города, был назван обладателем Пулитцеровской премии архитектурным критиком Алланом Темко как «потрясающая победа архитектурной свободы над бюрократической глупостью.. "
Первую тюрьму, установленную в Сан-Франциско, потребовал Алькальд, позже первый мэр Джон В. Гири, и построил ее в прибрежном бриге Эфемия на берегу бухты Йерба-Буэна. Позже была тюрьма на Бродвее и тюрьмы в двух залах правосудия на восточной стороне Портсмутской площади. Четвертый этаж здания после землетрясения Зала правосудия на Кирни-стрит служил тюрьмой до 1961 года, когда открылся нынешний Зал правосудия на Брайант-стрит, 850.
Тюрьма Ingleside, открытая в 1872 году на нынешнем месте Городского колледжа Сан-Франциско. Он служил самой большой тюрьмой в городе. Когда в 1934 году в Сан-Бруно открылась бывшая тюрьма графства 3, тюрьма Инглесайд была снесена и началось строительство Городского колледжа. Бывшая окружная тюрьма № 3 закрылась в 2006 году, после более чем 70 лет службы, и заменена современным учреждением прямого наблюдения, County Jail 5. Тюрьма Сан-Бруно 1934 года была снесена в 2012 году.
Большинство округов Сан-Франциско Заключенные, такие как 60% заключенных в тюрьмах США и 70% заключенных в тюрьмах Калифорнии, не были осуждены ни за какие преступления. Они ждут суда, часто месяцами, обычно потому, что не могут позволить себе залог.
Заключенные, склонные к насилию, которые хотят измениться, могут участвовать в партнерском проекте Решить остановить насилие (RSVP) с Community Works West, целью которой является сокращение насилия в обществе и рецидивизма.