Salmonella enterica subsp. enterica | |
---|---|
Колонии Salmonella Typhimurium на чашке с энтеросолюбильным агаром | |
Научная классификация | |
Домен: | Бактерии |
Тип: | Proteobacteria |
Класс: | Gammaproteobacteria |
Заказ: | Enterobacterales |
Семейство: | Enterobacteriaceae |
Род: | Salmonella |
Виды: | S. enterica |
Подвид: | S. е. subsp. enterica |
Трехчленное название | |
Salmonella enterica subsp. enterica . |
Salmonella enterica subsp. enterica является подвидом Salmonella enterica, палочковидной, жгутиковой, аэробной, грамотрицательной бактерии. Многие из патогенных сероваров видов S. enterica относятся к этому подвиду, включая тот, который вызывает брюшной тиф.
S. enterica subsp. enterica содержит большое количество сероваров, которые могут инфицировать широкий спектр позвоночных хозяев. Индивидуальные члены варьируются от хорошо адаптированных к хозяину (способных инфицировать лишь узкий круг видов) до отображения широкого круга хозяев. В настоящее время используется ряд методов для различения серотипов. К ним относятся поиск наличия или отсутствия антигенов, типирование фага, молекулярный фингерпринтинг и биотипирование, при котором серовары дифференцируются по питательным веществам, которые они способны ферментировать. Возможным фактором в определении диапазона конкретных сероваров-хозяев является опосредованное фагом приобретение небольшого количества генетических элементов, которые делают возможной инфекцию конкретного хозяина. Кроме того, предполагается, что серовары, которые инфицируют узкий круг видов, отошли от предков с широким кругом хозяев, и с тех пор специализировались и утратили способность инфицировать некоторых хозяев.
Выбор сероваров с известными хозяевами перечисленные. Поскольку существует более 2500 сероваров Salmonella enterica subsp. enterica, этот список неполный.
Серовар | Вид-хозяин |
---|---|
Salmonella Choleraesuis | Свинья |
Salmonella Dublin | Крупный рогатый скот |
Salmonella Enteritidis | Люди, грызуны, galliformes |
Salmonella Gallinarum | Galliformes |
Salmonella Hadar | Люди, галлиообразные, кролики |
Salmonella Heidelberg | Люди, galliformes, свиньи |
Salmonella Infantis | Люди, домашняя птица |
Salmonella Paratyphi | Люди |
Salmonella Typhi | Люди |
Salmonella Typhimurium | Люди, крупный рогатый скот, свиньи, овцы, лошади, грызуны, galliformes |
Исследование данных из 37 стран, собранных в период с 2001 по 2007 год, показало, что наиболее распространенным сероваром Salmonella, изолированным от случаев заболевания человека, был Enteritidis, обнаруживаемый в среднем в 43,5% случаев, затем Typhimurium (17,1% случаев), Newport (3,5%), Infantis (1,8%), Virchow (1,5%), Hadar (1,5%) и Agona (0,8%).
Один штамм Salmonella, который Недавно в США появилась Salmonella javiana. «Вспышка произошла в 2002 году, среди участников Игр по трансплантации в США был 141 случай. Из 141 случая большинство случаев были либо реципиентами трансплантата (34%), либо людьми, получавшими иммуносупрессивную терапию (32%)». Растет число серотипов сальмонелл, которые обладают множественной лекарственной устойчивостью (МЛУ), что было выявлено Национальной системой мониторинга устойчивости к противомикробным препаратам CDC. «Salmonella javiana вызывает 4% нетифодных инфекций Salmonella в США каждый год».
В ноябре 2016 года в Пакистане появился новый штамм серовара Typhi с широкой лекарственной устойчивостью (ШЛУ) Salmonella enterica serovar Typhi, в основном в городах Хайдарабад и Карачи. Штаммы с множественной лекарственной устойчивостью присутствуют с конца 1970-х годов в Африке и Азии. Эти штаммы ШЛУ устойчивы ко всем вариантам лечения антибиотиками: хлорамфениколу, ампициллину, триметоприм-сульфаметоксазолу, фторхинолонам и цефалоспоринам третьего поколения. Вспышка продолжается с 2016 года.
Генетические данные показывают, что серовары можно разделить на две группы: одна вызывает кишечную инфекцию и обладает широким набором метаболических возможностей, а вторая которая обычно вызывает инвазивную инфекцию, часто у узкого круга хозяев, и демонстрирует деградацию анаэробных метаболических путей. Считается, что эти метаболические возможности важны для получения питательных веществ в сложной и ограниченной по питательным веществам среде воспаленного кишечника.
Серовары могут быть обозначены полностью или в сокращенной форме. В краткой форме указан род Salmonella, за которым следует серовар с заглавной буквы и без курсива. Полное обозначение Salmonella Typhi - Salmonella enterica subsp. enterica, серовар Typhi. У каждого серовара также может быть много штаммов, что позволяет быстро увеличить общее количество антигенно изменчивых бактерий.
Инвазивные штаммы нетифоидных сальмонеллы, такие как Salmonella Typhimurium ST313, недавно были признаны вызывающими новые болезни в Африке. Недостаток иммунитета у основных хозяев, связанный с ВИЧ, малярией и недоеданием, способствовал широкому распространению этого заболевания и необходимости использовать дорогие противомикробные препараты в самых бедных службах здравоохранения в мире. Но также было показано, что бактериальные факторы, такие как повышенная активность гена вирулентности pgtE, из-за однонуклеотидного полиморфизма (SNP) в его промоторной области, оказывают большое влияние на патогенез этой конкретной сальмонеллы. тип последовательности.